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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002921`

染色体: Chr08 坐标: 29241539-29246650 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002921`
名称	SmilChr08G002921
描述	uncharacterized SmilChr08G002921
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	29241539 - 29246650 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998294`
GeneID	`130998294`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998294`
原始查询	`SmilChr08G002921`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0208400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0208400` - identity=37.2; qcov=0.762; evalue=1.33e-158; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02992 (Transposase_21); PF13952 (DUF4216); PF13960 (DUF4218)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998294

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779709.1`
2	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057779709.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779709.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779709.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779709.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:29243656`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr8:29243704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B18,C62
`Chr8:29243707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,B41,C44
`Chr8:29243711`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A10
`Chr8:29243736`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B122,B61
`Chr8:29243737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B11
`Chr8:29243772`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C17,C49
`Chr8:29243887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:29243997`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B132,B96,C24
`Chr8:29244003`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B5,C11,C29,C6
`Chr8:29244009`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B58
`Chr8:29244011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B132,B4,B96,C24,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779709.1

960 aa

480

960

Transposase_21

DUF4218

DUF4216

PF02992 Transposase_21 207-418 aa PF13960 DUF4218 604-717 aa PF13952 DUF4216 886-954 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779709.1`	Pfam	`PF02992`	Transposase_21	Family	207	418	1e-81	273.9	Transposase family tnp2
`XP_057779709.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	604	717	6.9e-46	155.5	Domain of unknown function (DUF4218)
`XP_057779709.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	886	954	2e-17	64.2	Domain of unknown function (DUF4216)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923726.1
CAAGTCGGGTCCCCTCCTTTGGTTTAGTTCTCATCTGCCCTAATTCGCAAATTTCTTGAAAATCCCCAAATCGCGCCGCCTCCGGTTTGAATACCGCCGCCCGTCACCGCTCCTCTGTCGGTGAGCACGCCGCCGCCTGCAACCCGTCGGCCGGCCGTTCCTCCTGCAGCTTCTCCGCCGCCGCCTGCAACCCCTCCGCCGGCCGAACCTCCTCCAACTTCTCAAAATTAATCAGTCTCTCGCCTCAAAGAAAGAATTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998294
ATGATGGCAACCGAATATAATCAATTTGATGCTGCTGATGATGATGACAATGAAGATGATCAAAGCACATACCACAATATGGTGATAGACGTTGCTGCTTCACAATTCAATATTGAACAGCCGCCTAATCCTGAAGCACAACAATTATATGATATGTTGAGTGCTGCAGATAGGGAGTTATGGCCTGGTTGCAACGCTCATTCACAATTATCTTTTGTGGCTCGTCTAATGTGTTTGAAGGCAGAGGGGAACATGTCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779709.1
MMATEYNQFDAADDDDNEDDQSTYHNMVIDVAASQFNIEQPPNPEAQQLYDMLSAADRELWPGCNAHSQLSFVARLMCLKAEGNMSERCFDQWLELIKEILPEHNLAPNNFYSTKKLLSGMGLPVEKIDCCRNNCMLFWGEDSEDIECKHCNEPRYQQSDTSSASSSRTLVAVKKMFYFPLTPRLQRLYASKATAADMRWHASSVDDGIMRHPADSPAWKHLSQKFPSFAEESRNVRLGLSTDGFQPFGQSGQQYSSWLV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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