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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002923`

染色体: Chr08 坐标: 29296020-29299953 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002923`
名称	SmilChr08G002923
描述	putative clathrin assembly protein At5g57200
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	29296020 - 29299953 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997524`
GeneID	`130997524`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997524`
原始查询	`SmilChr08G002923`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative clathrin assembly protein At5g57200
产物	putative clathrin assembly protein At5g57200
Arabidopsis	`AT5G57200` (AT5G57200) ENTH/ANTH/VHS superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835826] identity=57.5; qcov=0.878; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0175700` - identity=52.5; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0000149 (SNARE binding); GO:0005545 (1-phosphatidylinositol binding); GO:0005546 (phosphatidylinositol-4,5-bisphosphate binding); GO:0005905 (clathrin-coated pit); GO:0006900 (vesicle budding from membrane); GO:0030136 (clathrin-coated vesicle); GO:0032050 (clathrin heavy chain binding); GO:0048268 (clathrin coat assembly); GO:0072583 (clathrin-dependent endocytosis)
KEGG	-
Pfam	PF07651 (ANTH)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997524

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057778844.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057778844.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057778844.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778844.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778844.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:29298182`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B73,B85,C24,C75
`Chr8:29298241`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B76,B84,C39,C6
`Chr8:29298654`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr8:29299090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B49,C32,C68
`Chr8:29299479`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C8,D7
`Chr8:29299487`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C40,D6
`Chr8:29299526`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B122
`Chr8:29299526`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B122
`Chr8:29299758`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778844.1

590 aa

295

590

ANTH

PF07651 ANTH 29-306 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778844.1`	Pfam	`PF07651`	ANTH	Repeat	29	306	1.9e-86	290.2	ANTH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922861.1
GAACATCTGGTGGCATGTTCGGGAGAGAGAGAGACAGAGACAGAGATTGGTTAGGCCAACTTTGGTGAGAGAGAGAGAGAATCTAGAATTGACTTTGTTTTCGTTATTATTGAAATGAGGTTACGCAAAATAGAGAGGAAGAATTTGTCAAAATCCCCTGTGTTTCTCTCTCTCTCTCTCCATCTCTCGGATCTGTGGCATCTTTGTTGTGATGATGAGCAATGCTGAATGAGATGAGATGGAAAGCTTTAGAAAAGCCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997524
ATGGAAAGCTTTAGAAAAGCCTATGGAGCTCTAAAGGACTCCACCAAAGTTGGCCTTGCCAGTCTCAATAGTGACTTTAAGGTGTTGGATGTTGCAATCGTCAAAGCCACCAACCATGTCGAATGTCCCCCCAAGGAAAGGCACGTCGGAAAGATACTCGCAGCAATATCTGCAAACCGCCCACGAGCCGATGTAGGCTACTGCATTCATGCGCTATGTCGAAGATTATCCAAGACGCGCAACTGGATTGTTGCAATAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778844.1
MESFRKAYGALKDSTKVGLASLNSDFKVLDVAIVKATNHVECPPKERHVGKILAAISANRPRADVGYCIHALCRRLSKTRNWIVAIKTLIVVHRTLREGDPAFREELVRYSQRGKLFQLYNFKDDSSTLAWDCSAWVRTYSLFLEERVECFKTLQYDLEVDRASKPGPQVSKTHSKTRFLNGDQLLEHLPSLQQLMYRLICCQPEGLACHNYLVQFALAMVLKESFRIYCSINDGIINLVDLFFDMPKHDAVRALDIYRR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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