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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002943`

染色体: Chr08 坐标: 29453312-29454491 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002943`
名称	SmilChr08G002943
描述	uncharacterized SmilChr08G002943
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	29453312 - 29454491 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997546`
GeneID	`130997546`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997546`
原始查询	`SmilChr08G002943`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0328500; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT5G27260` (AT5G27260) Myb/SANT-like DNA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832784] identity=19.8; qcov=1.03; evalue=1.53e-07; confidence=weak
Rice	`Os02g0328500` - identity=32.2; qcov=0.42; evalue=1.61e-17; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997546

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778869.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778869.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778869.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778869.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057778869.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:29453380`	`TGG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	12	A20,B108,B15,B18,B30,B56,B69,C23,C31,C44,C55,C84
`Chr8:29453383`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	A20,B108,B15,B18,B30,B56,B69,C23,C31,C44,C55,C84
`Chr8:29453413`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C61
`Chr8:29453413`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr8:29453414`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	21	A20,B108,B15,B18,B30,B47,B56,B60,B69,B72,B87,B97,C23,C31,C44,C49,C51,C52,C55,C7,C84
`Chr8:29453443`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	45	A20,A5,B102,B108,B127,B140,B15,B16,B18,B21,B23,B24,B30,B31,B49,B56,B60,B66,B69,B72,B78,B85,B87,B97,C23,C24,C25,C26,C31,C33,C42,C44,C49,C50,C52,C55,C64,C66,C7,C70,C74,C79,C83,C84,D1
`Chr8:29453445`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	45	A20,A5,B102,B108,B112,B127,B15,B16,B18,B21,B23,B24,B30,B31,B49,B56,B60,B66,B69,B72,B78,B85,B87,B97,C23,C24,C25,C26,C31,C33,C42,C44,C49,C50,C52,C55,C64,C66,C7,C70,C74,C79,C83,C84,D1
`Chr8:29453448`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	43	A20,A5,B102,B108,B112,B127,B15,B16,B18,B21,B23,B24,B30,B31,B49,B56,B60,B66,B69,B72,B85,B87,B97,C23,C24,C25,C26,C31,C33,C42,C44,C49,C50,C52,C55,C64,C66,C7,C74,C79,C83,C84,D1
`Chr8:29453450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C85
`Chr8:29453473`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B112,C50,C64,C66,C83
`Chr8:29453508`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C23
`Chr8:29453532`	`ATG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	16	A1,A20,A4,B102,B15,B18,B23,B27,B30,B87,B97,C26,C31,C55,C68,C84

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922886.1
TCGTTGCCGGGTCAACAAATCTGACAAAACACGGCGGAGTTGGACCAGTAAGGAAGAGGAAACACTGATGGCAGCGTTGAAAGAATTGGTAGCGCAGGGATGGAAGTCCGACAACGGCTTCCGGGCAGGTTACTTGAACAAGCTAGAAGATGCGATGAGGGCTGCATACCCAGGCACAGATTTGAAAGGCGTCCCCCACATTAACTCCAAAATATGCGCAATGAAAAAGAACTACTACAGCTTGTCCTTGATGTTAGGAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997546
ATGGCAGCGTTGAAAGAATTGGTAGCGCAGGGATGGAAGTCCGACAACGGCTTCCGGGCAGGTTACTTGAACAAGCTAGAAGATGCGATGAGGGCTGCATACCCAGGCACAGATTTGAAAGGCGTCCCCCACATTAACTCCAAAATATGCGCAATGAAAAAGAACTACTACAGCTTGTCCTTGATGTTAGGACGTACTGGCTTTGGGTTTAACGCTAATGGCACCATTGATTGCACAGACGAAGAATGGGCTGAAATAGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778869.1
MAALKELVAQGWKSDNGFRAGYLNKLEDAMRAAYPGTDLKGVPHINSKICAMKKNYYSLSLMLGRTGFGFNANGTIDCTDEEWAEIVKKDPNARLMRDKPWPLIDDWKLVFGKDRATGEHAEDLMDAVTAMYRRENIAQHAPDGDYHVNMEEVNENEGVDQNEGVDESVSQNHKGAERAREETSGGRKRKAAREETGGAYEMLLREMMNNTGQRLETLANRVGYDFDIGKARKEVFEVLKAIPELSLDERFDVCELLAYK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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