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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002955`

染色体: Chr08 坐标: 29580191-29581583 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002955`
名称	SmilChr08G002955
描述	expansin-A4-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	29580191 - 29581583 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997555`
GeneID	`130997555`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997555`
原始查询	`SmilChr08G002955`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	expansin-A4-like
产物	expansin-A4-like
Arabidopsis	`AT2G39700` (EXPA4) expansin A4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818553] identity=80.4; qcov=0.992; evalue=4.32e-147; confidence=high
Rice	`Os03g0822000` (OsEXPA7) - identity=80.8; qcov=0.953; evalue=1.63e-147; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0009664 (plant-type cell wall organization)
KEGG	-
Pfam	PF01357 (Expansin_C); PF03330 (DPBB_1); PF22514 (EXPB1_D1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997555

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057778898.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057778898.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778898.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778898.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778898.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:29580482`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:29580545`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr8:29580567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:29580621`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A5,B105,B11,B6,C45,C5
`Chr8:29580624`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	A19,A5,B105,B11,B6,C45,C5
`Chr8:29580655`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B11
`Chr8:29580655`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B11
`Chr8:29580660`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B11
`Chr8:29580660`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B11
`Chr8:29580998`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	35	A10,A11,A5,B105,B112,B134,B140,B18,B2,B24,B28,B33,B34,B47,B56,B6,B69,B8,B80,B91,B94,C13,C20,C30,C4,C40,C55,C65,C66,C70,C80,C86,D1,D11,D5
`Chr8:29581000`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	35	A10,A11,A5,B105,B112,B134,B140,B18,B2,B24,B28,B33,B34,B47,B56,B6,B69,B8,B80,B91,B94,C13,C20,C30,C4,C40,C55,C65,C66,C70,C80,C86,D1,D11,D5
`Chr8:29581003`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	29	A10,A11,A5,B112,B134,B2,B28,B33,B34,B47,B56,B6,B69,B8,B80,B91,B94,C13,C30,C4,C40,C55,C65,C66,C70,C80,C86,D1,D5

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778898.1

261 aa

130

261

EXPB1_D1

DPBB_1

Expansin_C

PF22514 EXPB1_D1 38-163 aa PF03330 DPBB_1 68-157 aa PF01357 Expansin_C 168-245 aa

XP_057778899.1

257 aa

128

257

EXPB1_D1

DPBB_1

Expansin_C

PF22514 EXPB1_D1 38-129 aa PF03330 DPBB_1 68-157 aa PF01357 Expansin_C 164-241 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778898.1`	Pfam	`PF22514`	EXPB1_D1	Domain	38	163	1.3e-08	36.0	EXPB1-like domain 1
`XP_057778898.1`	Pfam	`PF03330`	DPBB_1	Domain	68	157	6.6e-23	81.5	Lytic transglycolase
`XP_057778898.1`	Pfam	`PF01357`	Expansin_C	Domain	168	245	1.2e-28	99.7	Expansin C-terminal domain
`XP_057778899.1`	Pfam	`PF22514`	EXPB1_D1	Domain	38	129	5.7e-08	33.9	EXPB1-like domain 1
`XP_057778899.1`	Pfam	`PF03330`	DPBB_1	Domain	68	157	6.7e-23	81.5	Lytic transglycolase
`XP_057778899.1`	Pfam	`PF01357`	Expansin_C	Domain	164	241	1.2e-28	99.8	Expansin C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922915.1
TTATGTTGGTGTCCGTCAAAATTCTCAATTCAAAAGGCATGAGAGAGAGAGAGAGAAGGGGATAGTAAAGGGCGTATTAATTAGAGGGATGGAAGTGTGATTAGGCCCCCCCGCCCCGCCACTCCCACTATCCACCATAAGTACACCCTCCCGCTTTCCATTCCACACAAACATCTCTCTCCCAAAAATGCGGCCATTGAAGATGATCCTTTGCATGGCCACCATCCTCTGCTCTCTCACATCCGCCGGCGCCATAATCC...

XM_057922916.1
GGCATGAGAGAGAGAGAGAGAAGGGGATAGTAAAGGGCGTATTAATTAGAGGGATGGAAGTGTGATTAGGCCCCCCCGCCCCGCCACTCCCACTATCCACCATAAGTACACCCTCCCGCTTTCCATTCCACACAAACATCTCTCTCCCAAAAATGCGGCCATTGAAGATGATCCTTTGCATGGCCACCATCCTCTGCTCTCTCACATCCGCCGGCGCCATAATCCCCGGCGTCTACGGCGGCACCACCTGGCAAGCCGCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997555
ATGCGGCCATTGAAGATGATCCTTTGCATGGCCACCATCCTCTGCTCTCTCACATCCGCCGGCGCCATAATCCCCGGCGTCTACGGCGGCACCACCTGGCAAGCCGCCCACGCTACATTCTACGGCGGCAGCGACGCCTCCGGCACCATGGGTGGTGCCTGCGGCTACGGAAACCTATACAGCCAGGGTTACGGCGTGAAGACGGCGGCACTGAGCACGGCGCTCTTCAACAACGGGCTGAGCTGCGGCGCCTGCTTCGA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778898.1
MRPLKMILCMATILCSLTSAGAIIPGVYGGTTWQAAHATFYGGSDASGTMGGACGYGNLYSQGYGVKTAALSTALFNNGLSCGACFEIKCDAAQDAKWCNPGSPSILVTATNFCPPNYALPNDNGGWCNPPRPHFDLAMPMFLKIAQYRAGIVPVNFRRVACRKQGGIRFTINGFRYFNLVLITNVAGAGDVVRASIKGGNTQWVPLSRNWGQNWQSNAVLVGQALSFRVTGSDRRTSTSWNVAPSNWQFGQTFTGKNFR...

XP_057778899.1
MRPLKMILCMATILCSLTSAGAIIPGVYGGTTWQAAHATFYGGSDASGTMGGACGYGNLYSQGYGVKTAALSTALFNNGLSCGACFEIKCDAAQDAKWCNPGSPSILVTATNFCPPNYALPNDNGGWCNPPRPHFDLAMPMFLKIAQYRAGIVPVNFRRKQGGIRFTINGFRYFNLVLITNVAGAGDVVRASIKGGNTQWVPLSRNWGQNWQSNAVLVGQALSFRVTGSDRRTSTSWNVAPSNWQFGQTFTGKNFRV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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