当前解析结果
SmilChr08G002961| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002961 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002961 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G002961 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 29623519 - 29624538 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130998298 |
|---|---|
| GeneID | 130998298 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998298 |
| 原始查询 | SmilChr08G002961 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os03g0587600; species=rice; confidence=weak |
| 产物 | hit=Os03g0587600; species=rice; confidence=weak |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | Os03g0587600- identity=45.8; qcov=0.142; evalue=2.46e-06; confidence=weak |
| GO | GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0008270 (zinc ion binding) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998298 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057779713.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.20000 | XP_057779713.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779713.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779713.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057779713.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:29623524 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B112,B95 |
Chr8:29623530 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B125,B131,C73 |
Chr8:29623549 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A10,A6,C43,C47 |
Chr8:29623554 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A21,B72,C85,D6 |
Chr8:29623564 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B70 |
Chr8:29623605 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B35,B8 |
Chr8:29623607 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B113,B24,B70 |
Chr8:29623614 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B101,B49,C22 |
Chr8:29623620 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B54,B79,B99 |
Chr8:29623718 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B19,C34,C43 |
Chr8:29623731 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A9,B111,B134,B77 |
Chr8:29623774 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 13 | A3,B10,B134,B40,B57,B68,C10,C49,C55,C73,C9,D2,D7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。