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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002972`

染色体: Chr08 坐标: 29739516-29741020 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002972`
名称	SmilChr08G002972
描述	uncharacterized protein At3g17950
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	29739516 - 29741020 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997571`
GeneID	`130997571`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997571`
原始查询	`SmilChr08G002972`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L36 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831872]; symbol=AT5G02440; hit=AT5G02440; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	60S ribosomal protein L36 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831872]; symbol=AT5G02440; hit=AT5G02440; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G02440` (AT5G02440) 60S ribosomal protein L36 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831872] identity=46.3; qcov=0.832; evalue=4.31e-25; confidence=medium
Rice	`-` -
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF30539 (At3g17950)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997571

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057778919.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057778919.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778919.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778919.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778919.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:29739846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C76,D8
`Chr8:29739933`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr8:29740688`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:29740725`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	137	A1,A13,A15,A19,A20,A23,A24,A3,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B102,B103,B104,B106,B107,B109,B111,B113,B114,B118,B120,B123,B125,B129,B130,B131,B133,B134,B135,B136,B139,B140,B15,B16,B17,B19,B22,B24,B28,B30,B32,B36,B38,B39,B41,B44,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B52,B53,B55,B56,B6,B61,B63,B64,B68,B69,B77,B78,B80,B84,B86,B87,B90,B91,B92,B94,B95,B96,B97,B99,C1,C11,C12,C16,C18,C19,C2,C26,C27,C29,C3,C30,C31,C34,C39,C40,C41,C42,C43,C44,C46,C48,C5,C50,C51,C53,C56,C6,C61,C62,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C7,C70,C72,C73,C74,C75,C76,C79,C8,C81,C82,C84,C85,C87,C9,D11,D2,D3,D4,D5
`Chr8:29740811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr8:29740837`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B140,B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778919.1

197 aa

197

At3g17950

PF30539 At3g17950 3-192 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778919.1`	Pfam	`PF30539`	At3g17950	Family	3	192	1.8e-65	221.4	At3g17950-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922936.1
AGTTTAGTACTTGGAGGAAAGAGCTGCGGATGCGGTGCCGTTAAGCTTATGCGGAGCGAAAAAGAAAAAAAAAATTGATTTAATTCATAATACAATACCCTCAAATAAAATCAAATGCGTTGTGTCTGAAATGAATTCCCACTTCCTTCTTCTTAAAACCTTCACTCACTACTTCTCCCCTCTTCTAATCAACTTCAATCCACCATTATAATGGCTCAACAACAGGAAGAAGGGTGGCCGCTGGGGCTGCAGCCGGTGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997571
ATGGCTCAACAACAGGAAGAAGGGTGGCCGCTGGGGCTGCAGCCGGTGAATGTAAGAGTTGGTGGGCTGGATAGGAACCGTGATCTCAATGCCTCTCTCTCCTTCAACACTTTGCTCACCGCTTCCCCAATCTCCTCCGACGATTTCTCTTCTGATCTTGATACTCAGTCGACAGGTTCGTTCTTTCACGACAAGAGCATCACTCTGGGGAGCCTGATTGGCATCTCGAGCATCCTAGAGCTGTCGCGGAGATCAAGGCG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778919.1
MAQQQEEGWPLGLQPVNVRVGGLDRNRDLNASLSFNTLLTASPISSDDFSSDLDTQSTGSFFHDKSITLGSLIGISSILELSRRSRRARAPDEAARSKKTRTWFLSLCSRLSTDAVSISNAPSLAHLLEAERRGAAAAAAAVDDFSHVSNHNSLFVGGHVAPPPRPSSPFARDLLSHHNAHGPPLLLSCLCAHSSSN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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