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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002978`

染色体: Chr08 坐标: 29868195-29870344 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002978`
名称	SmilChr08G002978
描述	dof zinc finger protein DOF5.1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	29868195 - 29870344 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997576`
GeneID	`130997576`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997576`
原始查询	`SmilChr08G002978`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	dof zinc finger protein DOF5.1-like
产物	dof zinc finger protein DOF5.1-like
Arabidopsis	`AT3G55370` (OBP3) OBF-binding protein 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824703] identity=38.1; qcov=1.04; evalue=9.44e-60; confidence=medium
Rice	`Os03g0821200` (OsDof16) - identity=38.2; qcov=1.23; evalue=5.67e-47; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF02701 (Zn_ribbon_Dof)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997576

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778921.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778921.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778921.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778921.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057778921.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:29868632`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	B10,B101,B134,B38,B39,B71,B75,B78,B8,C21,C35,C45,C63,C69,C86
`Chr8:29868637`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	15	B10,B101,B134,B38,B39,B71,B75,B78,B8,C21,C35,C45,C63,C69,C86
`Chr8:29868647`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:29868676`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B75,C11,C35,C45
`Chr8:29868799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	B10,B101,B134,B38,B39,B71,B75,B78,B8,C11,C21,C63,C69,C86
`Chr8:29868897`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C76,D8
`Chr8:29868973`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B33,B49,C32,C68
`Chr8:29869055`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B15,B95,C15,C40
`Chr8:29869173`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B101,B39,B71,B75,C11
`Chr8:29869182`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B101,B39,B71,C11
`Chr8:29869201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr8:29869356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778921.1

337 aa

168

337

Zn_ribbon_Dof

PF02701 Zn_ribbon_Dof 76-131 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778921.1`	Pfam	`PF02701`	Zn_ribbon_Dof	Family	76	131	6e-33	113.5	Dof domain, zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922938.1
GTGTCAAACCAAATATAGTCTTAATTAGTGTGATAATAATGCTGGGAACCCACACTCCCAATCAATATATTCTCCCCCTGCCTCTCTAAATTATTTTGCATAAAAGAAATCTCCACTTTTTCCATGCAATCACAGCAATGCCTCCACACAAAAAGAAGCTTAAAGGCTAAGTAATTAAGAAACTGAAACCCTAAAAAGCAATAAAACAAAACTAGACAGAGTGAAAACAAATTAGTACTTGGTGTATTCTCTCTCTCTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997576
ATGGTTTTTTCTTCAATTCCTGCTTATCTTGATCCATCCAACTGGAATCAGCAACAAAATCATCAAATAATCGGAAGCAGCAGCGCCAACCCTTTACTCCCACCTCCACCGCATCCAGGGGGCCCTCCGCCGCCTCCTCCGCCTCAGCCGCATGGAGGCGGCGGAATCCGGCCCGGCTCCATGGCGGAGCGAGCTCGCATGGCCAACATACCCATGCCGGAAACATCCCTGAAATGCCCTCGCTGCGAATCCACAAACAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778921.1
MVFSSIPAYLDPSNWNQQQNHQIIGSSSANPLLPPPPHPGGPPPPPPPQPHGGGGIRPGSMAERARMANIPMPETSLKCPRCESTNTKFCYFNNYSLSQPRHFCKTCRRYWTRGGALRNVPVGGGCRRNKRSKSSNSKSPASSDRQANNNPSSTSTVSTNSNSAAANMLGLTPPLPPLRFMSPLGQFTDNFTADMGLNYSAIAASTVGTSDMNFHGAGSLLGGSGSGGVASLLSSEGGGIEPWRLQQVQQFPFLDASSQG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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