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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002980`

染色体: Chr08 坐标: 29879382-29880407 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002980`
名称	SmilChr08G002980
描述	uncharacterized SmilChr08G002980
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	29879382 - 29880407 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998302`
GeneID	`130998302`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998302`
原始查询	`SmilChr08G002980`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os10g0351414; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os10g0351414; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G40390` (AT1G40390) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840761] identity=25; qcov=0.704; evalue=2.18e-09; confidence=low
Rice	`Os10g0351414` - identity=26.5; qcov=1.06; evalue=1.61e-30; confidence=low
GO	GO:0003824 (catalytic activity)
KEGG	-
Pfam	PF03372 (Exo_endo_phos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998302

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779716.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057779716.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057779716.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779716.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779716.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:29879430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C66,C69
`Chr8:29879437`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B19,B22,B27,D4,D6
`Chr8:29879450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,B24
`Chr8:29879488`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	15	A14,A9,B15,B18,B60,B8,C12,C17,C18,C31,C6,C69,C85,D2,D4
`Chr8:29879501`	`TCG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	25	A1,A16,A6,A8,B111,B14,B140,B17,B28,B57,B63,B70,B79,B84,B95,C22,C29,C35,C36,C47,C52,C68,C74,C86,C87
`Chr8:29879523`	`AAG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	29	A1,A6,A8,B103,B14,B15,B28,B60,B63,B70,B79,B8,B84,B95,C12,C17,C18,C22,C29,C36,C52,C6,C68,C69,C74,C85,C86,C87,D2
`Chr8:29879527`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	29	A1,A6,A8,B103,B14,B15,B17,B28,B60,B63,B70,B79,B8,B84,B95,C12,C17,C18,C22,C29,C3,C36,C52,C6,C68,C74,C85,C86,D2
`Chr8:29879564`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B19,B22,B27,D4,D6
`Chr8:29879578`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A20,B8,C12,C6,D2
`Chr8:29879578`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A20,B8,C12,C6,D2
`Chr8:29879599`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	B8,C12,C17,C3,C6,D2
`Chr8:29879601`	`AAC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	6	B8,C12,C17,C3,C6,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779716.1

341 aa

170

341

Exo_endo_phos

PF03372 Exo_endo_phos 4-223 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779716.1`	Pfam	`PF03372`	Exo_endo_phos	Domain	4	223	8.2e-13	49.3	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923733.1
ATGAATGCTCTAAGTTGGAACTGCAGGGGACTCGGTCAACCTCTTGCAGTTCCTACTATTCTTGAACTCAACCGAGTTCATCGACCAAGTGTTATCTTCCTCTGCGAAACTCTCTCTCATCGCACTCGTTTGGAAGAGATTAAGAATCGTCTTAACTTTGATGGATGTTTTTCTGTTGACAGCTTGGGCAGGAGCGGAGGCCTTTGCATGATGTGGAAGAACTCTTATAACTGCTCTATCCTTGGTTACTCTCGAAACCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998302
ATGAATGCTCTAAGTTGGAACTGCAGGGGACTCGGTCAACCTCTTGCAGTTCCTACTATTCTTGAACTCAACCGAGTTCATCGACCAAGTGTTATCTTCCTCTGCGAAACTCTCTCTCATCGCACTCGTTTGGAAGAGATTAAGAATCGTCTTAACTTTGATGGATGTTTTTCTGTTGACAGCTTGGGCAGGAGCGGAGGCCTTTGCATGATGTGGAAGAACTCTTATAACTGCTCTATCCTTGGTTACTCTCGAAACCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779716.1
MNALSWNCRGLGQPLAVPTILELNRVHRPSVIFLCETLSHRTRLEEIKNRLNFDGCFSVDSLGRSGGLCMMWKNSYNCSILGYSRNHIDLCITNANGNWRLTGYYGFPERSRRRDSWTLLRRLAGVNNLSWLIIGDFNDLLDPGDKRGRVDHPNWLFTGFRVAVLDCGLSDIPLHGYPFTWSGGLGSDNFVEERLDRGMATQTWRNLFPNAMVSSLLAPISDHAPIILKCNGMPSPLSPRRFRFENKWCLEPEFPNIVRD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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