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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002981`

染色体: Chr08 坐标: 29883659-29884372 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002981`
名称	SmilChr08G002981
描述	uncharacterized SmilChr08G002981
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	29883659 - 29884372 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998303`
GeneID	`130998303`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998303`
原始查询	`SmilChr08G002981`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=low
产物	Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108]; symbol=AT3G09510; hit=AT3G09510; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G09510` (AT3G09510) Ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820108] identity=29.6; qcov=1.05; evalue=2.21e-28; confidence=low
Rice	`Os01g0967700` - identity=30.1; qcov=0.785; evalue=6.23e-20; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998303

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779717.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057779717.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779717.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779717.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779717.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:29883667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B95,C40
`Chr8:29883699`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:29883702`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr8:29883703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A3
`Chr8:29883719`	`AGG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	48	A13,A5,A6,A8,B100,B102,B123,B126,B129,B131,B132,B136,B137,B17,B18,B26,B33,B35,B43,B50,B53,B6,B61,B62,B64,B70,B82,B86,B89,B90,B94,B96,B98,C18,C24,C46,C48,C52,C6,C66,C67,C68,C72,C84,C87,D1,D4,D5
`Chr8:29883722`	`A`	`AAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	48	A13,A5,A6,A8,B100,B102,B123,B126,B129,B131,B132,B136,B137,B17,B18,B26,B33,B35,B43,B50,B53,B6,B61,B62,B64,B70,B82,B86,B89,B90,B94,B96,B98,C18,C24,C46,C48,C52,C6,C66,C67,C68,C72,C84,C87,D1,D4,D5
`Chr8:29883745`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A3,B13,C36,C8,D7
`Chr8:29883760`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A24,B95,C40
`Chr8:29883760`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A24,B95,C40
`Chr8:29883829`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B27
`Chr8:29883829`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B27
`Chr8:29883839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B46,C1,C68,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779717.1

237 aa

118

237

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 32-121 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779717.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	32	121	1.5e-21	77.6	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923734.1
ATGGAGGCGGACATCAAGGATGTCACCAACATTCCTCTTTCGCCCTCCATGCAATCGGATAGGATTGTTTGGCATTTCTCCGATGACGGTCATTACTCTGTTAAAACGGCCTACAAGCTGGCCAGCTCCCTTACTCTTGACGAGACCCACAAGGTAGATGGTAATTGGAGAGTTCTTTGGCGTATGGATGTGCCTCCTAAGGTGCGGCATTTTCTTTGGAGAGCTGCTCGTAATAACCTTCCTACTAAAGAAAATCTACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998303
ATGGAGGCGGACATCAAGGATGTCACCAACATTCCTCTTTCGCCCTCCATGCAATCGGATAGGATTGTTTGGCATTTCTCCGATGACGGTCATTACTCTGTTAAAACGGCCTACAAGCTGGCCAGCTCCCTTACTCTTGACGAGACCCACAAGGTAGATGGTAATTGGAGAGTTCTTTGGCGTATGGATGTGCCTCCTAAGGTGCGGCATTTTCTTTGGAGAGCTGCTCGTAATAACCTTCCTACTAAAGAAAATCTACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779717.1
MEADIKDVTNIPLSPSMQSDRIVWHFSDDGHYSVKTAYKLASSLTLDETHKVDGNWRVLWRMDVPPKVRHFLWRAARNNLPTKENLLSRGLTVGGECPICRSGYENTWHIFFACPFAETCWRTSNLFPHVDSITARSDSFTQALTRVLDDKNVNRKANVGMILWQIWRDRNTVVWKEVFPNPAKSVDSALGRSDWLSARQPTEGCSSSSSPTARCLGWHTLPTGSILCSVDAAFFED

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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