当前解析结果
SmilChr08G002991| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002991 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002991 |
| 描述 | UNC93-like protein 3 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 30007079 - 30011192 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130997583 |
|---|---|
| GeneID | 130997583 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997583 |
| 原始查询 | SmilChr08G002991 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | UNC93-like protein 3 |
| 产物 | UNC93-like protein 3 |
| Arabidopsis | AT3G09470 (AT3G09470)Major facilitator superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820104] identity=66.5; qcov=0.984; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os12g0566900- identity=61.8; qcov=0.934; evalue=5.91e-173; confidence=high |
| GO | GO:0055075 (potassium ion homeostasis) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF05978 (UNC-93) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997583 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Vacuole membrane | 液泡膜 | 1.00000 | XP_057778933.1 |
| 2 | Vacuole | 液泡 | 0.80000 | XP_057778933.1 |
| 3 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.20000 | XP_057778933.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057778933.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057778933.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:30007327 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D4 |
Chr8:30007486 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B15,C15 |
Chr8:30007767 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B40 |
Chr8:30008454 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B89,B99 |
Chr8:30009178 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C73 |
Chr8:30009990 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A22,B101,C30 |
Chr8:30010008 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B102 |
Chr8:30010131 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C17,C83 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057778933.1PF05978
UNC-93 56-417 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057778933.1 |
Pfam | PF05978 |
UNC-93 | Family | 56 | 417 | 2.1e-36 | 126.6 | Ion channel regulatory protein UNC-93 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。