当前解析结果
SmilChr08G002993| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002993 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002993 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G002993 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 30027803 - 30028458 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130997590 |
|---|---|
| GeneID | 130997590 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997590 |
| 原始查询 | SmilChr08G002993 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997590 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057778938.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057778938.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057778938.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057778938.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057778938.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:30027897 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 5 | B27,B48,C40,C9,D6 |
Chr8:30027897 |
TG |
T |
1bp_deletion | CDS_variant | 5 | B27,B48,C40,C9,D6 |
Chr8:30027921 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B100 |
Chr8:30027936 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D6 |
Chr8:30027998 |
TAG |
T |
2bp_deletion | frameshift_variant | 1 | B102 |
Chr8:30027998 |
TAG |
T |
2bp_deletion | CDS_variant | 1 | B102 |
Chr8:30028030 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 3 | A9,C1,C66 |
Chr8:30028030 |
AT |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 3 | A9,C1,C66 |
Chr8:30028031 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 24 | A4,A5,B102,B106,B108,B109,B135,B136,B138,B14,B28,B39,B48,B53,B56,B78,B92,C16,C24,C29,D1,D10,D5,D6 |
Chr8:30028040 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A9,C1,C66,C79 |
Chr8:30028042 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A9,C1,C66 |
Chr8:30028052 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B131,B138,B55 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。