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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002995`

染色体: Chr08 坐标: 30051707-30053832 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002995`
名称	SmilChr08G002995
描述	actin-depolymerizing factor 1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	30051707 - 30053832 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997592`
GeneID	`130997592`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997592`
原始查询	`SmilChr08G002995`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	actin-depolymerizing factor 1
产物	actin-depolymerizing factor 1
Arabidopsis	`AT5G59890` (ADF4) actin depolymerizing factor 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836111] identity=90.7; qcov=1; evalue=5.12e-95; confidence=high
Rice	`Os02g0663800` (OsADF1) - identity=76.8; qcov=0.993; evalue=8.3e-81; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0015629 (actin cytoskeleton); GO:0030042 (actin filament depolymerization); GO:0051015 (actin filament binding)
KEGG	-
Pfam	PF00241 (Cofilin_ADF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997592

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057778940.1`
2	Cytoskeleton	细胞骨架	1.00000	`XP_057778941.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057778940.1`
4	Cell projection	细胞突起	0.60000	`XP_057778941.1`
5	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057778940.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:30052073`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A18,B33,B49,C32,C68
`Chr8:30052073`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A18,B33,B49,C32,C68
`Chr8:30052148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr8:30052396`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778940.1

183 aa

183

Cofilin_ADF

PF00241 Cofilin_ADF 7-91 aa PF00241 Cofilin_ADF 130-182 aa

XP_057778941.1

139 aa

139

Cofilin_ADF

PF00241 Cofilin_ADF 7-138 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778940.1`	Pfam	`PF00241`	Cofilin_ADF	Domain	7	91	1.8e-37	128.6	Cofilin/tropomyosin-type actin-binding protein
`XP_057778940.1`	Pfam	`PF00241`	Cofilin_ADF	Domain	130	182	1.8e-37	128.6	Cofilin/tropomyosin-type actin-binding protein
`XP_057778941.1`	Pfam	`PF00241`	Cofilin_ADF	Domain	7	138	1.2e-42	145.4	Cofilin/tropomyosin-type actin-binding protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922958.1
GTTTACATAAATAAGCACATCACGTATGTGACATGTCCTCTATTCATAAATTCATTTGGTTCATGTCTAACTCCATTTCTTAATATCAATTGACTTCTATTTTACTAAAGTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATGTATATATATTTATTTATTGGAGATTCTCATAATTTTTAGAGACAAAAAAGTTTCATCATACGCTTTTACGATGTACCGTACGTGTAGTTTGAATCTAGCTTAACGCGATC...

XM_057922957.1
GCTAGATAAGCAAGCACTTCCGAAATGCAATGTTAGTTTTACCAATACTTAACCTTACGCGGCGCAGCGCAACGCAATGCAATGCTTTCTAACCACATCCACACCCTAAAACAATACACCTATCTCACACGCAATAAAAACTCTTCACCAAATGCACTCAATAAAAGAGAGCTGATAATCGTATCAGCACCGCGCCTCCCTCCTATCGGCGGGTCTCACATTTTTCTCTCTCTATTCCTTTTTTAATATTCGCGCATTTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997592
ATGGCAAACGCCGCATCTGGAATGGCTGTGCATGATGATTGCAAGCTGAGGTTCTTGGAACTGAAGGCGAAAAGGACTCACCGCTTCATTGTCTTTAAGATTGAAGAGAAACAGAAGCAGGTTATTGTTGAAAAAATTGGCGAGCCAACTCAGAACTACGAGGACTTCGCTGCTAGTCTTCCAGCTGATGAATGCAGATACGCTGTTTATGACTTTGATTTTGTTACTGCAGAGAACTGCCAGAAAAGCAGGATTTTCTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778940.1
MANAASGMAVHDDCKLRFLELKAKRTHRFIVFKIEEKQKQVIVEKIGEPTQNYEDFAASLPADECRYAVYDFDFVTAENCQKSRIFFIAWYSQHFITTFYGFYLIVVVVFCCISSLVESASRSVSIGFCFFHVRCPDTSRVRSKMIYASSKDRFKRELDGIQVELQATDPTEMDLDVIKSRAS

XP_057778941.1
MANAASGMAVHDDCKLRFLELKAKRTHRFIVFKIEEKQKQVIVEKIGEPTQNYEDFAASLPADECRYAVYDFDFVTAENCQKSRIFFIAWCPDTSRVRSKMIYASSKDRFKRELDGIQVELQATDPTEMDLDVIKSRAS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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