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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002996`

染色体: Chr08 坐标: 30065463-30068254 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002996`
名称	SmilChr08G002996
描述	organelle RRM domain-containing protein 2, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	30065463 - 30068254 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997593`
GeneID	`130997593`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997593`
原始查询	`SmilChr08G002996`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	organelle RRM domain-containing protein 2, mitochondrial-like
产物	organelle RRM domain-containing protein 2%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT2G37510` (AT2G37510) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818327] identity=56.6; qcov=1.01; evalue=1.51e-44; confidence=medium
Rice	`Os03g0278800` - identity=60.8; qcov=0.987; evalue=1.27e-54; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997593

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057778943.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057778943.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778943.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778943.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778943.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:30066188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,A5
`Chr8:30066209`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C1
`Chr8:30067832`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C87,D11
`Chr8:30067871`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B122,B40,D4
`Chr8:30067875`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C15
`Chr8:30067884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B121,B13,B46,B79,C49
`Chr8:30067888`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C15
`Chr8:30067969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	A13,B125,B134,B22,B30,B36,B47,B52,B61,B94,C16,C26,C44,C46,C5,C56,C79
`Chr8:30067991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr8:30067993`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,C31
`Chr8:30068027`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B13,C8,C82,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778943.1

150 aa

150

RRM_1

PF00076 RRM_1 42-108 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778943.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	42	108	3e-19	69.4	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922960.1
GCGCCGCTAGACGCAGATGATCTTAAATCACACTTAATTCCTCTGCTCCCTTTTTCCCTTCCCTCGTCTGCATCTTGAATTCTAGCCTTCTCCCCCTACTCCTTTTTTCCCCTTCCCTCGTCTGCATCTTCCCTTCTCACTCGTCTGCATCCCTCCTCTGTATCTTCAGTTCCAGCTTTCGGGAAGAGGCAAAAGAGCCCCGTAACTTCGGGAGAAGGGGGGTCGCACAAATCCTCGGCGCGGAATAAAAAGGTCTGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997593
ATGGCCTTCGCTTCAGCTTTCCGTCGCATTTTTAACGGATCATCCACGCCGTCGCTCAATATACGCTCGCAGTTCTGTTCGATTCGTTTCAGTTCCACTCTTCCGACGCTCACCTCTCCTAAGCTCTTCATCAGCGGTCTTTCAAGAACGACAACTGATGATAACCTATACAAGGCATTTGCACCTTTTGGAATTCTTCGTGAGGCAAAAATTATCATTGACAGAGGCTCTGGGAAATCAAGGGGGTTCGGTTTTGTAAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778943.1
MAFASAFRRIFNGSSTPSLNIRSQFCSIRFSSTLPTLTSPKLFISGLSRTTTDDNLYKAFAPFGILREAKIIIDRGSGKSRGFGFVTYDTVEEAEKAREGMNAKFLDGWVIFVDPAKPREAPQQPPPPRRDMQSTETGYTTNKTVGWSGY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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