当前解析结果
SmilChr08G002998| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002998 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002998 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G002998 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 30077958 - 30081067 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130997595 |
|---|---|
| GeneID | 130997595 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997595 |
| 原始查询 | SmilChr08G002998 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | BIP130; symbol=BIP130; hit=Os05g0113500; species=rice; confidence=low |
| 产物 | BIP130; symbol=BIP130; hit=Os05g0113500; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT2G37480 (AT2G37480)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818325] identity=41.9; qcov=0.299; evalue=5.97e-11; confidence=weak |
| Rice | Os05g0113500 (BIP130)- identity=35.3; qcov=0.767; evalue=5.69e-19; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997595 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057778947.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.60000 | XP_057778947.1 |
| 3 | Cytosol | 细胞质基质 | 0.40000 | XP_057778947.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057778947.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057778947.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:30078422 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B50 |
Chr8:30078481 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B26 |
Chr8:30079183 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C6 |
Chr8:30079579 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A18,B33,B49,C32,C68 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。