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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003000`

染色体: Chr08 坐标: 30091172-30093982 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003000`
名称	SmilChr08G003000
描述	uncharacterized SmilChr08G003000
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	30091172 - 30093982 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997597`
GeneID	`130997597`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997597`
原始查询	`SmilChr08G003000`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=55.8; qcov=0.161; evalue=1.71e-35; confidence=weak
Rice	`Os01g0872900` - identity=53.7; qcov=0.571; evalue=1.96e-139; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997597

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778948.1`
2	Chromosome	染色体	0.20000	`XP_057778948.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057778948.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778948.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778948.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:30091377`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C79
`Chr8:30091390`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	52	A1,A20,A3,A4,B1,B107,B11,B112,B119,B12,B121,B123,B124,B129,B132,B133,B136,B140,B18,B36,B37,B4,B40,B5,B55,B62,B67,B84,B87,B98,C17,C19,C24,C29,C31,C34,C47,C59,C67,C70,C76,C79,C80,C84,C87,C9,D11,D2,D6,D7,D8,D9
`Chr8:30091391`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	B132,B75,B87,B94,B95,C11,C21,C32,C39,C48,C58,C61
`Chr8:30091398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C40,C79
`Chr8:30091410`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B65,C76
`Chr8:30091441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,B73
`Chr8:30091442`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B35,D7
`Chr8:30091453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B21,B41,B45,C57,C62
`Chr8:30091481`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B83,C52,C56
`Chr8:30091485`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B21
`Chr8:30091485`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B21
`Chr8:30091504`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B121,B64,C16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778948.1

646 aa

323

646

DUF8418

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF28509 DUF8418 261-299 aa PF04827 Plant_tran 369-568 aa PF13359 DDE_Tnp_4 398-561 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778948.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	261	299	4.5e-16	59.0	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057778948.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	369	568	2.2e-106	354.8	Plant transposon protein
`XP_057778948.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	398	561	5.3e-10	39.8	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922965.1
TCTTTTGAAAATTAGGCTTTACATTTTGTTTTAGAGTTTTTTTTTTAAGAGTTGAATTTGTTTGATTTCGTTTTTATTTTATTTTATTTTTGACGGAATTTCGTTTTTATTTTGTATTGCATACTTTCACTTGTGAGATATTTATACTCTATATTTGTATTTTAATAAATGGTGTGTGAAACAATTAAAAATTTTGAGTTTGGATGAGAAATTTTTATGTAGAGACTGTTTAGTTATTTGAGATTAATTTTGTCATATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997597
ATGGATCGAGGCAATAATTCTTTCTTCAACTCTCAAAATTTCAACCCCTCCCAAGACTATTATCCAAATCTTGCTGATATTACAAGCTCCAATGAATTCCCAGAGTTTGATTATGCTATGAATTCAGAATTCTCGCAGAATCCTACTGATTCTCCTATTTCTGAATATCACCAAACCTCTGAAAATTTTTCTGAAAATTTTTCTGCAAACCCTTCCAACAATGCGCAAAGTTTGACTGATATAGAAGATATATCACTAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778948.1
MDRGNNSFFNSQNFNPSQDYYPNLADITSSNEFPEFDYAMNSEFSQNPTDSPISEYHQTSENFSENFSANPSNNAQSLTDIEDISLMSAWCFVSNNPIVGTNRNSKSFWKTVADMYEQSRADNPEIGGRRSVESLRNRYKRLNKNVTLWVDAYKKAYERRASGQSKEDIEKAAQAIYGKPKFTHHEVFEKVNLQKMASSSNIGASNSSDDEACEQSVAEHNRQLDRIIENVVIQAASLSVQPTNHVVRARRRYIERRHEI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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