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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003010`

染色体: Chr08 坐标: 30209768-30211275 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003010`
名称	SmilChr08G003010
描述	F-box protein At5g03100-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	30209768 - 30211275 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997610`
GeneID	`130997610`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997610`
原始查询	`SmilChr08G003010`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At5g03100-like
产物	F-box protein At5g03100-like
Arabidopsis	`AT2G39490` (AT2G39490) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818534] identity=26.1; qcov=0.896; evalue=6.29e-15; confidence=low
Rice	`Os06g0713400` (OsFbox328) - identity=23.4; qcov=0.778; evalue=3.36e-06; confidence=weak
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00646 (F-box); PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997610

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778968.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778968.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778968.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778968.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057778968.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:30209980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B35
`Chr8:30209997`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B35
`Chr8:30210007`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,D4
`Chr8:30210056`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B109,B125,C21,C36,C83
`Chr8:30210098`	`C`	`CTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	A21,A24,B103,B108,B122,B125,B5,B57,B94,B98,C61,C65,D5
`Chr8:30210204`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B140,B35
`Chr8:30210218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:30210229`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B122,B82,C60,C61
`Chr8:30210338`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B33
`Chr8:30210386`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B125,B93
`Chr8:30210386`	`A`	`ATC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B125,B93
`Chr8:30210419`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B122,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778968.1

423 aa

212

423

F-box-like

F-box

PF12937 F-box-like 8-42 aa PF00646 F-box 8-43 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778968.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	8	42	1.4e-05	25.5	F-box-like
`XP_057778968.1`	Pfam	`PF00646`	F-box	Domain	8	43	7.7e-07	29.5	F-box domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922985.1
TCGTTTCATTTGTTGGCATTGTCAATAAGTTTGAACACAACCACTTTGTTAATTACTTATAAGACAAATCCTGTGAATCCATTCATCTACACTTTTGAGTTGATAGGATCTTCAAGAGAGAGAGTGAGAGAATGGAAGAAAAGGGTGATGTGTTGAGCAGCTTGCCAAGCGAAATTCTGCAGCACATAATCTCAATGCTTTCTCTGAAAGAGGCAGTTCAAATCAGCACTCTATCCACATCGTGGAGGAGACTAATGTGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997610
ATGGAAGAAAAGGGTGATGTGTTGAGCAGCTTGCCAAGCGAAATTCTGCAGCACATAATCTCAATGCTTTCTCTGAAAGAGGCAGTTCAAATCAGCACTCTATCCACATCGTGGAGGAGACTAATGTGCCCTTCCCGCCTCAACTTATCATCATCCAATCAAGAGCTGCATCACACCATCCAATCTCTGTCGGAATCCGGCGCCGGTTTTCGGACATTAATCCTCCACCTCGACGCCGCTGCCTTGGCCGTCTGCACCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778968.1
MEEKGDVLSSLPSEILQHIISMLSLKEAVQISTLSTSWRRLMCPSRLNLSSSNQELHHTIQSLSESGAGFRTLILHLDAAALAVCTKGVNGELHLDFSLHILIPTTFSLIVKQATRRPSFSHIKTLHLRSIPRLAGDTLSDLCSRVEDLKMEKCSGLESIEIESSESLKNLEISDCPNIVRIVLVSARKLKSLWYKGVFPLIRLLNVPNLVRVGLDLGDGLGGKELDCEDCVSLLSSLKDIESLQLSSCLVEALCCCGVI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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