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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003019`

染色体: Chr08 坐标: 30334548-30335407 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003019`
名称	SmilChr08G003019
描述	uncharacterized SmilChr08G003019
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	30334548 - 30335407 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997619`
GeneID	`130997619`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997619`
原始查询	`SmilChr08G003019`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816116]; symbol=AT2G16190; hit=AT2G16190; species=arabidopsis; confidence=high
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816116]; symbol=AT2G16190; hit=AT2G16190; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G16190` (AT2G16190) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816116] identity=51.6; qcov=0.824; evalue=3.62e-57; confidence=high
Rice	`Os05g0549500` - identity=50; qcov=0.777; evalue=5.01e-52; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF23324 (DUF7086)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997619

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778986.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057778986.1`
3	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057778986.1`
4	Nuclear body	核内小体	0.40000	`XP_057778986.1`
5	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057778986.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:30334775`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B110,D10
`Chr8:30334775`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B110,D10
`Chr8:30334779`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B110,D10
`Chr8:30334779`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B110,D10
`Chr8:30334839`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B105,B106,B109,C21,C36
`Chr8:30335061`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B56,B96,D4
`Chr8:30335133`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B133,B3,C11,C69
`Chr8:30335169`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778986.1

193 aa

193

DUF7086

PF23324 DUF7086 54-186 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778986.1`	Pfam	`PF23324`	DUF7086	Domain	54	186	1.2e-62	210.5	Domain of unknown function (DUF7086)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923003.1
AGTTTTGTTTTAGTTAGTTTAGTATGAAAATCCCGGTTATGAAGAAGAAGGTTGTTATGAGAGATCTGTTGCGGATTTTTCTTCCTAACTAATAACAAAGCTTCCACTGAAATCGGGGGCCTAATCTATTTAAACAGAAGCCGCTATTTCTGTTGAATTACAATCAATTAAATTAATGAGTATTGAAACTCCCTTGAGCATGGACAACGACGGCGAAGAAAACTACCTCCTCAACCTCTCCCTCTGCACACCTCCTTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997619
ATGAGTATTGAAACTCCCTTGAGCATGGACAACGACGGCGAAGAAAACTACCTCCTCAACCTCTCCCTCTGCACACCTCCTTCTCGGCCGGAAAAGTCGGTGGAAATCGCGGCGCCGTACCCGTGGGCGACGGAGCGGCGCGCGACAGTCCAGAGCATGGAGCAGCTGCGGGGCAAGGGCATCGACACGATCAGCGGCAGCGTGCAGTGCAAGCGGTGCGACAAGCAGTTCGAGGTGGAGTACGAGGTGGCGGGAAAGTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778986.1
MSIETPLSMDNDGEENYLLNLSLCTPPSRPEKSVEIAAPYPWATERRATVQSMEQLRGKGIDTISGSVQCKRCDKQFEVEYEVAGKFREVAQFIMEYREEMRHRAPAVWMAPTLPDCRFCEQRNCAKPVASKKKKDINWLFLFLGQMVGCCKLAELKYFCKHTRKHRTGAKDRVLYLTYLEICTQLHPHTTFH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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