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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003029`

染色体: Chr08 坐标: 30433779-30435968 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003029`
名称	SmilChr08G003029
描述	GEM-like protein 5
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	30433779 - 30435968 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997663`
GeneID	`130997663`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997663`
原始查询	`SmilChr08G003029`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	GEM-like protein 5
产物	GEM-like protein 5
Arabidopsis	`AT5G13200` (AT5G13200) GRAM domain family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831159] identity=68.6; qcov=0.916; evalue=9.08e-126; confidence=high
Rice	`Os09g0466300` - identity=49.5; qcov=0.728; evalue=9.75e-68; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02893 (GRAM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997663

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057779052.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779052.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057779052.1`
4	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057779052.1`
5	Endosome	内体	0.20000	`XP_057779052.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:30434110`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C77
`Chr8:30434144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A20,A25,B123,B37
`Chr8:30434261`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B74,B88,C73,C74
`Chr8:30434277`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:30435195`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B136
`Chr8:30435195`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B136
`Chr8:30435606`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	37	A13,A6,A7,B1,B106,B118,B125,B129,B134,B22,B36,B47,B5,B52,B6,B60,B61,B64,B78,B9,B90,B92,B94,C16,C25,C26,C27,C34,C37,C44,C46,C5,C50,C56,C72,C73,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779052.1

261 aa

130

261

GRAM

PF02893 GRAM 130-238 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779052.1`	Pfam	`PF02893`	GRAM	Domain	130	238	1.7e-15	57.6	GRAM domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923069.1
ACTCGTTAAATTTCTTGTAGAAAAAAAAATTACTCAAACTTCGCGGGATAGAGACCGGAGCGAGTACTGGAGTAGGATTGATGAAAATAAGTTCCATCTAGAACATTCCTTCCCCTTCCTTTCCTTTCGAATGAAGAATGGACATTTCTAGCAACGCCGACGTGCCCAAGTTGTCCCTTTTATTTAGTATTATCCAAATCAATCACCTTTGTTTCCTAATTTCTTTTCCGTGAAGTCGATTAGAAATAGATACATACAGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997663
ATGATGGCCACCACAAACGAGGACCAGAAAGCAACCAAACAGCCGGGGGCGGAGGAAGATACGGAGAAATGGGGGACCCACATAATGGGGGCGCCGGCGGCGCCGACAGTTCATCCGGGCAATCAGCAGGCGGCGCAGTGGCAGGGTGCGGGCTCACAGCAGCCTCACCAAATCCAGCAGCCGTACGTGGTGTTTGCGCCGGTGGAGAAGCCCGCCGACAACCCCCTTGAACATGTTGTCAGTCTCTTCAATTCTTGGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779052.1
MMATTNEDQKATKQPGAEEDTEKWGTHIMGAPAAPTVHPGNQQAAQWQGAGSQQPHQIQQPYVVFAPVEKPADNPLEHVVSLFNSWTRKAEDISRNVWHNLKTGPSVSGAAWGKVNLTAKAITEGGFESLFKQIFDSYPDEKLKKTFACYLSTTTGPVAGTLYLSTARLAFCSDRPLSFTAPSGQETWTYYKVTIPLGNIENVNPVIMKENPPEKYIHIVSVDRHEFWFMGFVNFEKASHHLLDSVSDFRARGTISQPVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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