Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003032`

染色体: Chr08 坐标: 30481635-30482350 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003032`
名称	SmilChr08G003032
描述	probable membrane-associated kinase regulator 3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	30481635 - 30482350 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997673`
GeneID	`130997673`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997673`
原始查询	`SmilChr08G003032`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable membrane-associated kinase regulator 3
产物	probable membrane-associated kinase regulator 3
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os05g0462200` - identity=42.2; qcov=0.348; evalue=4.83e-07; confidence=low
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0019210 (kinase inhibitor activity)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997673

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779069.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057779069.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057779069.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057779069.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779069.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:30481796`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B33
`Chr8:30481796`	`G`	`GA`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B33
`Chr8:30481919`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B88
`Chr8:30482251`	`TTC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	B13,B40,B71,B73,B89,C14,C76,C82,D8
`Chr8:30482257`	`C`	`CCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	13	A1,A3,B48,B55,B72,B77,B9,C29,C71,C81,C87,D11,D9
`Chr8:30482265`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	112	A14,A15,A16,A19,A20,A22,A24,A5,A9,B10,B100,B101,B102,B104,B106,B107,B109,B112,B117,B118,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B13,B131,B134,B136,B137,B138,B14,B140,B20,B21,B23,B26,B27,B28,B29,B3,B31,B32,B33,B34,B35,B37,B38,B39,B41,B49,B5,B52,B54,B56,B57,B59,B61,B64,B66,B67,B7,B70,B71,B79,B80,B83,B88,B89,B93,B96,B97,B99,C11,C12,C16,C19,C2,C20,C21,C22,C27,C3,C32,C36,C39,C4,C43,C48,C52,C59,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C77,C78,C79,C8,C86,C9,D10,D2,D4,D6,D7,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923086.1
TTTCCTCACTGACTACTTGGCATCATCCTTCCTTTAAAGGATGCTCTCTCATCTCATTCTTTCTTCTGAGAGAGAGAGAGAGAGATGGAGAGAGAGAGAATAGTTTCCATATGTGAAGATGAAGATGAAGAGTACATAGAGATGGAGCTGAGCTCATCATCAGCAAGCATAGAATTCGAGTTCCAAATGCCCGCCGCCACGGCCTCCCCCGCCGACCACCTCTTCCACAAAGGCAAACTCCTCCCACTCTACCTCCTCCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997673
ATGGAGAGAGAGAGAATAGTTTCCATATGTGAAGATGAAGATGAAGAGTACATAGAGATGGAGCTGAGCTCATCATCAGCAAGCATAGAATTCGAGTTCCAAATGCCCGCCGCCACGGCCTCCCCCGCCGACCACCTCTTCCACAAAGGCAAACTCCTCCCACTCTACCTCCTCCCCTCCACCCCACCGGAATCCGACGACGACTTCTTCTTCGAACTCAACACCTTCATCCACCACCACCCCACCCCCAAAATCTCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779069.1
MERERIVSICEDEDEEYIEMELSSSSASIEFEFQMPAATASPADHLFHKGKLLPLYLLPSTPPESDDDFFFELNTFIHHHPTPKISSPKAKKRSILAHKLKAYLKSLFLKSGKHKPSADTARRSFSSAVKRVSSSSSNSSCVSASSSFSLSQDLQCLRRTSSATETEGSIEAAIAHCKKSHHIF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器