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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003034`

染色体: Chr08 坐标: 30501271-30507237 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003034`
名称	SmilChr08G003034
描述	phosphatidate phosphatase PAH1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	30501271 - 30507237 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997627`
GeneID	`130997627`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997627`
原始查询	`SmilChr08G003034`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	phosphatidate phosphatase PAH1-like
产物	phosphatidate phosphatase PAH1-like
Arabidopsis	`AT3G09560` (PAH1) Lipin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820113] identity=50.4; qcov=1.06; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0615000` - identity=82.7; qcov=0.24; evalue=9.12e-126; confidence=weak
GO	GO:0008195 (phosphatidate phosphatase activity); GO:0044255 (GO:0044255)
KEGG	smil00561 (Glycerolipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil00564 (Glycerophospholipid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF04571 (Lipin_N); PF08235 (LNS2); PF16876 (Lipin_mid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997627

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057778996.1`
2	Endosome	内体	0.60000	`XP_057778996.1`
3	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	0.40000	`XP_057778996.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057778996.1`
5	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057778996.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:30501567`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:30502658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,B114,B46,C15,C57
`Chr8:30504245`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,C73,C74
`Chr8:30504505`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B28,B7,B80
`Chr8:30504509`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C15
`Chr8:30504667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,C78,C80
`Chr8:30504850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr8:30504863`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr8:30505153`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C57
`Chr8:30505366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr8:30505496`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B33,B49,C32,C68
`Chr8:30505498`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778996.1

890 aa

445

890

Lipin_N

Lipin_mid

LNS2

PF04571 Lipin_N 1-95 aa PF16876 Lipin_mid 480-587 aa PF08235 LNS2 642-864 aa

XP_057778997.1

890 aa

445

890

Lipin_N

Lipin_mid

LNS2

PF04571 Lipin_N 1-95 aa PF16876 Lipin_mid 480-587 aa PF08235 LNS2 642-864 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778996.1`	Pfam	`PF04571`	Lipin_N	Family	1	95	2.6e-31	108.4	lipin, N-terminal conserved region
`XP_057778996.1`	Pfam	`PF16876`	Lipin_mid	Family	480	587	1.8e-14	54.3	Lipin/Ned1/Smp2 multi-domain protein middle domain
`XP_057778996.1`	Pfam	`PF08235`	LNS2	Domain	642	864	6.4e-96	320.8	LNS2 (Lipin/Ned1/Smp2)
`XP_057778997.1`	Pfam	`PF04571`	Lipin_N	Family	1	95	2.6e-31	108.4	lipin, N-terminal conserved region
`XP_057778997.1`	Pfam	`PF16876`	Lipin_mid	Family	480	587	1.8e-14	54.3	Lipin/Ned1/Smp2 multi-domain protein middle domain
`XP_057778997.1`	Pfam	`PF08235`	LNS2	Domain	642	864	6.4e-96	320.8	LNS2 (Lipin/Ned1/Smp2)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093133.1
ACGAAGGTGAAATTGGAAAATTATGATCCTGGCTCCTTAATTATCAATAAACGTTTAATAATATCCTCAGTCCAAATTGCGATGCTCTCCCTGATTGAAGAACAATTTCATTTTTATTCGCAGTTATTCGGAGGATTCTATACAACCAAAATAAGAATTGGAAGAACATTCAAGAAAACTGAAACTCATTTTTATGACCTGCCTGTTTTAGAGCGAGAATGAAGCACCCTCTTGAGACGAATTTCGATGGTTGCATTGAC...

XM_057923014.1
ACGAAGGTGAAATTGGAAAATTATGATCCTGGCTCCTTAATTATCAATAAACGTTTAATAATATCCTCAGTCCAAATTGCGATGCTCTCCCTGATTGAAGAACAATTTCATTTTTATTCGCAGTTATTCGGAGGATTCTATACAACCAAAATAAGAATTGGAAGAACATTCAAGAAAACTGAAACTCATTTTTATGACCTGCCTGTTTTAGAGCGAGAATGAAGCACCCTCTTGAGACGAATTTCGATGGTTGCATTGAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997627
ATGGATGTGGTTGGTAAAGTTAGCAGCATTATTACTCAGGGCATGTACTCTGTAGCCACACCATTTCACCCGTTTGGTGGGGCTGTCGACATAATTGTCGTTAAGCAGCAAGATGGGACGTTTAGGAGTACGCCTTGGTATGTACGATTTGGGAAATTTCAGGGTGTTCTCAAGGGTGCGGAGAAGGTAGTACAGATTGAGGTTAATGATGTTGAAGCAGATTTTCATATGTATCTTGATAACTCAGGCGAAGCTTACTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778996.1
MDVVGKVSSIITQGMYSVATPFHPFGGAVDIIVVKQQDGTFRSTPWYVRFGKFQGVLKGAEKVVQIEVNDVEADFHMYLDNSGEAYFVREVDDVSECLKDLDNLEGGVNSNHYNSFNEGDLSGQDADGMPDTHLNMRAEKLRRVESDAAAYVFYEFSDEHSSVEGSPKISEHSPSRYDTLDSVEHALELQESNSEVVLVSVDGHILTAPISSSEKNGENVQLSTPQFHLGPGGGTEEYSSGEGNWASDCLSDAHKVGDTC...

XP_057778997.1
MDVVGKVSSIITQGMYSVATPFHPFGGAVDIIVVKQQDGTFRSTPWYVRFGKFQGVLKGAEKVVQIEVNDVEADFHMYLDNSGEAYFVREVDDVSECLKDLDNLEGGVNSNHYNSFNEGDLSGQDADGMPDTHLNMRAEKLRRVESDAAAYVFYEFSDEHSSVEGSPKISEHSPSRYDTLDSVEHALELQESNSEVVLVSVDGHILTAPISSSEKNGENVQLSTPQFHLGPGGGTEEYSSGEGNWASDCLSDAHKVGDTC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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