当前解析结果
SmilChr08G003035| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003035 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003035 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003035 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 30522151 - 30524768 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130997671 |
|---|---|
| GeneID | 130997671 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997671 |
| 原始查询 | SmilChr08G003035 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997671 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 1.00000 | XP_057779064.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057779064.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779064.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779064.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057779064.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:30522657 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B52,C28,C68,D4 |
Chr8:30522669 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B100,B33,C3 |
Chr8:30522695 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 12 | B121,B132,B27,B69,B71,B92,B97,C78,C80,C87,D1,D5 |
Chr8:30522699 |
T |
TCC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | A3 |
Chr8:30522699 |
T |
TCC |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | A3 |
Chr8:30522702 |
C |
CT |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | A3 |
Chr8:30522702 |
C |
CT |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | A3 |
Chr8:30522707 |
T |
TC |
1bp_insertion | frameshift_variant | 1 | A3 |
Chr8:30522707 |
T |
TC |
1bp_insertion | CDS_variant | 1 | A3 |
Chr8:30522715 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A3 |
Chr8:30522741 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B74,C73,C74 |
Chr8:30522781 |
ATG |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 37 | A15,A16,A18,A2,A9,B1,B107,B112,B118,B27,B28,B29,B3,B31,B34,B40,B54,B57,B67,B7,B72,B80,B83,C12,C16,C3,C49,C51,C52,C59,C6,C63,C67,C8,C86,D11,D6 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。