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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003042`

染色体: Chr08 坐标: 30581638-30582660 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003042`
名称	SmilChr08G003042
描述	neutral ceramidase 3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	30581638 - 30582660 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997676`
GeneID	`130997676`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997676`
原始查询	`SmilChr08G003042`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	neutral ceramidase 3-like
产物	neutral ceramidase 3-like
Arabidopsis	`AT5G58980` (AT5G58980) Neutral/alkaline non-lysosomal ceramidase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836015] identity=76.8; qcov=0.906; evalue=5.08e-62; confidence=high
Rice	`Os01g0624000` - identity=69.9; qcov=0.891; evalue=3.86e-57; confidence=high
GO	GO:0005576 (extracellular region); GO:0017040 (N-acylsphingosine amidohydrolase activity); GO:0042759 (long-chain fatty acid biosynthetic process); GO:0046512 (sphingosine biosynthetic process); GO:0046514 (ceramide catabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF04734 (Ceramidase_alk)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997676

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057779072.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057779072.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057779072.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779072.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779072.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:30581912`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B136,B23
`Chr8:30582113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:30582126`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C32,C68
`Chr8:30582152`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C15
`Chr8:30582164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C77
`Chr8:30582183`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,D9
`Chr8:30582188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A19,B107,C57
`Chr8:30582206`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C15
`Chr8:30582207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B53,C42
`Chr8:30582247`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A19
`Chr8:30582247`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A19
`Chr8:30582265`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B35,B44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779072.1

138 aa

138

Ceramidase_alk

PF04734 Ceramidase_alk 22-137 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779072.1`	Pfam	`PF04734`	Ceramidase_alk	Domain	22	137	3.4e-48	165.3	Neutral/alkaline non-lysosomal ceramidase, N-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923089.1
TGGCAAATTTTGACGTATTAAGTGGAAAACTGAAACGGCTATCTACTAACTAAAGTTATAAGCCGCTAATTCTTTATAATGATTAATGACATAACCTCCAATTTGCATAATTTTTAATCAGAATAGACCAAAACCCAAACAGCGGAAACCGCTGCCACGTTCCAGATAAAACTAAGGGTATACATTGTTGCGACAACAACTAACATTATATCTATGTACACTCTTGTCTATATATATAACTTGAATAAATCTTCAACATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997676
ATGTACAATCGCGGAGCTCTAAGTCTAGCCATCATCACCTGCTTCGTAGTTGCTAATGCAGACTACTTAATAGGGGTGGGGAGCCACGACATGACCGGCCCGGCAGCCGGAGTCAATATGATGGGTTATGCTAACATGGAGCAGGTCACCGGAGGCATACATTTCCAGCTCCGGGCACGGGCCTTCGTCGTCGCTGAGACCGACCAAGCTGGTGCTCGAATCGCCTTTGTTAACCTCGATGTTGGGATGGCCTCCCAACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779072.1
MYNRGALSLAIITCFVVANADYLIGVGSHDMTGPAAGVNMMGYANMEQVTGGIHFQLRARAFVVAETDQAGARIAFVNLDVGMASQLVTIKVLERLKSRYGELYSEENVAISGTHTHAGPGGYLQYVTYSVTSLGFVP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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