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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003046`

染色体: Chr08 坐标: 30612829-30613604 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003046`
名称	SmilChr08G003046
描述	pathogenesis-related protein PRB1-3
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	30612829 - 30613604 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997668`
GeneID	`130997668`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997668`
原始查询	`SmilChr08G003046`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	pathogenesis-related protein PRB1-3
产物	pathogenesis-related protein PRB1-3
Arabidopsis	`AT1G01310` (AT1G01310) CAP (Cysteine-rich secretory proteins, Antigen 5, and Pathosis-related 1 protein) superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839333] identity=44.7; qcov=0.671; evalue=3.67e-35; confidence=medium
Rice	`Os10g0191300` (OsPR1#101) - identity=42.5; qcov=0.695; evalue=5.97e-33; confidence=medium
GO	GO:0005615 (GO:0005615)
KEGG	-
Pfam	PF00188 (CAP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997668

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057779061.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779061.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779061.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779061.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779061.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:30612913`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,C48
`Chr8:30612920`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr8:30612998`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B74,C73,C74,D11
`Chr8:30613000`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B56,B96,C15,C39,D4
`Chr8:30613105`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,B101,B25
`Chr8:30613123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr8:30613231`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C57
`Chr8:30613232`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C1
`Chr8:30613255`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr8:30613257`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B127
`Chr8:30613257`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B127
`Chr8:30613301`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779061.1

210 aa

105

210

CAP

PF00188 CAP 67-193 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779061.1`	Pfam	`PF00188`	CAP	Domain	67	193	1.2e-24	88.1	Cysteine-rich secretory protein family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923078.1
AAAAAAACATCTCCAGGCAAATATGGGAAGACCGATGACGAGGGCAAGGGTGTGCATTTTCCTGATAATCGCCGCCGCCTTGGCGGCATCAGCGGCGGCGACGGTCGTGCACAGCACCCCAAAAAAGCAACTGAGGAAGCGGCGGCCCGCCCACAACAAAGTGGGCGGACTGATCCCGGCGGTCTTCGTGCCGACCCTGAACCTGGAGCAGCAGGACTACCTGAATGCCCACAACGACTTCCGGCGGTCGGCGGGGATGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997668
ATGGGAAGACCGATGACGAGGGCAAGGGTGTGCATTTTCCTGATAATCGCCGCCGCCTTGGCGGCATCAGCGGCGGCGACGGTCGTGCACAGCACCCCAAAAAAGCAACTGAGGAAGCGGCGGCCCGCCCACAACAAAGTGGGCGGACTGATCCCGGCGGTCTTCGTGCCGACCCTGAACCTGGAGCAGCAGGACTACCTGAATGCCCACAACGACTTCCGGCGGTCGGCGGGGATGCCGGCGCTGACGTGGGACGCGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779061.1
MGRPMTRARVCIFLIIAAALAASAAATVVHSTPKKQLRKRRPAHNKVGGLIPAVFVPTLNLEQQDYLNAHNDFRRSAGMPALTWDAKLAAVAQAWAERRRGDCNYRRHSSSPYGENIFFMKYREFSPRDVVQWWFSESKMYDSRQLRCRCAPEREGCECGHFLNVVWRNTKKVGCSGIVYCNDQGGVYIVCEYDPPALMSGANPFTGLRS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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