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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003052`

染色体: Chr08 坐标: 30684106-30687009 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003052`
名称	SmilChr08G003052
描述	glutathione S-transferase L3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	30684106 - 30687009 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997665`
GeneID	`130997665`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997665`
原始查询	`SmilChr08G003052`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutathione S-transferase L3-like
产物	glutathione S-transferase L3-like
Arabidopsis	`AT5G02780` (GSTL1) glutathione transferase lambda 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831800] identity=65.8; qcov=0.916; evalue=2.29e-107; confidence=high
Rice	`Os03g0283100` (OsGSTL2) - identity=64.9; qcov=0.954; evalue=1.39e-104; confidence=high
GO	GO:0004364 (glutathione transferase activity)
KEGG	smil00480 (Glutathione metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02798 (GST_N); PF13409 (GST_N_2); PF13410 (GST_C_2); PF13417 (GST_N_3); PF16865 (GST_C_5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997665

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057779057.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057779057.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779057.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779057.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779057.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:30684643`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr8:30684658`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B6,C34
`Chr8:30685775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102
`Chr8:30685913`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A19,B114,B122,B46,B84,B96,C15,C39,C57,D4
`Chr8:30685914`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	178	A1,A13,A15,A16,A18,A2,A20,A21,A22,A24,A25,A3,A4,A6,A7,B1,B101,B105,B106,B107,B108,B109,B110,B111,B112,B115,B118,B120,B123,B124,B125,B127,B129,B13,B133,B134,B137,B139,B14,B140,B17,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B31,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B40,B41,B44,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B54,B55,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B64,B66,B67,B68,B69,B7,B71,B72,B73,B74,B75,B77,B78,B8,B80,B83,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B92,B93,B94,B95,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C13,C14,C16,C17,C18,C20,C21,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C34,C35,C36,C37,C38,C41,C44,C46,C47,C49,C5,C50,C52,C53,C54,C55,C56,C59,C6,C62,C65,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C8,C80,C81,C82,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D7,D8
`Chr8:30685943`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,A3
`Chr8:30686124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C77
`Chr8:30686387`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B133,B135,B82,C56,C70
`Chr8:30686406`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	B13,B19,B99,C31,C66,C70,C76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779057.1

239 aa

120

239

GST_N

GST_N_3

GST_N_2

GST_C_5

GST_C_2

PF02798 GST_N 29-100 aa PF13417 GST_N_3 30-106 aa PF13409 GST_N_2 36-101 aa PF16865 GST_C_5 131-207 aa PF13410 GST_C_2 150-209 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779057.1`	Pfam	`PF02798`	GST_N	Domain	29	100	3.6e-08	34.3	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
`XP_057779057.1`	Pfam	`PF13417`	GST_N_3	Domain	30	106	2.8e-22	79.5	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
`XP_057779057.1`	Pfam	`PF13409`	GST_N_2	Domain	36	101	1.8e-18	67.6	Glutathione S-transferase, N-terminal domain
`XP_057779057.1`	Pfam	`PF16865`	GST_C_5	Domain	131	207	2.9e-08	35.0	Glutathione S-transferase, C-terminal domain
`XP_057779057.1`	Pfam	`PF13410`	GST_C_2	Domain	150	209	5e-08	33.7	Glutathione S-transferase, C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923074.1
TAACATTTATTACGTCATCAATGACGAAATCATGAACAGCCCCCAGGTTCGATCTCTATAAGTAAGGGTTCACACATCATCACTCTGCCATTCGCAAATTCTGGAATCAACCATGGCTGCGACTTATGTTGAAGAAGTGCTTCCTCCGGTGTTGGATTCTACTTCAGAACCTCCTCCTCTCTTTGATGGAACTACTAGGCTGTATGTCAATTACCAGTGCCCATTTGCGCAGCGTGTATGGATCGTCAGGAACTATAAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997665
ATGGCTGCGACTTATGTTGAAGAAGTGCTTCCTCCGGTGTTGGATTCTACTTCAGAACCTCCTCCTCTCTTTGATGGAACTACTAGGCTGTATGTCAATTACCAGTGCCCATTTGCGCAGCGTGTATGGATCGTCAGGAACTATAAGGGCTTACAGGACGAGATAAAACTGGTCCCAATTGACCTTCAAAACAGGCCTGCTTGGTACAAGGAGAAAGTATATCCCCAAAATAAGGTGCCTTCGTTGGAGCACAATGGCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779057.1
MAATYVEEVLPPVLDSTSEPPPLFDGTTRLYVNYQCPFAQRVWIVRNYKGLQDEIKLVPIDLQNRPAWYKEKVYPQNKVPSLEHNGKIIGESLDLVKYIDTNFKGPSLLPDDPAKKKFAEELIAYXQDTFINNVFASFRGDPAKQAGSEFDYLETALHKFEEDGPFFLGQFSQVDVVYVPFVERIQPFLYEVWKYDITSGRPKLAKWIEEINKIDAYKPTKADPQLIVQKYKSMFLGQK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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