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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003063`

染色体: Chr08 坐标: 30816712-30817766 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003063`
名称	SmilChr08G003063
描述	60S ribosomal protein L4-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	30816712 - 30817766 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997680`
GeneID	`130997680`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997680`
原始查询	`SmilChr08G003063`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	60S ribosomal protein L4-like
产物	60S ribosomal protein L4-like
Arabidopsis	`AT3G09630` (AT3G09630) Ribosomal protein L4/L1 family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820120] identity=76.9; qcov=0.919; evalue=1.15e-43; confidence=medium
Rice	`Os03g0796501` (OsRPL4) - identity=70.8; qcov=0.899; evalue=1.75e-37; confidence=medium
GO	GO:0003723 (RNA binding); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022625 (cytosolic large ribosomal subunit)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997680

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057779075.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.40000	`XP_057779075.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057779075.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779075.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779075.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:30817184`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B96,C39,D4
`Chr8:30817218`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B96,C39,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093145.1
CTCATAGCCAACACACACACATTTTTACCAAATCAAGCTTGGGTTCGTTGTTCCCAAATCTGGTGACATTCGGCAAGGAAATTCCGAATCTCAATCGCGGTGCCGCTACTTGTGATGGATGCATTTTTACCAAATTTTGCATTGATCGCATTGCCGCTACTGCCGAGAAGATGCAGCCCAAGTATGTAAGCCCAATAAAATGGGCCCATATGCCCATTAACGCAGGCCCAATAATAATAATGCAGAATGTCCACTATAAA...

XM_057923092.1
CTATAAATTTCTCCCTCTCTGCAAACCCTATTTTTTCACTCTTAGTTGTTTTCCCGTATCCAGCCCCCGGGAAAATGGCCGCCGCCGCCGCCCGCCCCCTCGTCACCGTGCAGTCCCTGGAGAACGATATGGCCACCGACGGAGGAGCCGCAGCCAACTGCCTGCCTCTTCCTGACGTAATGAAAGCCGCTATCCGCCCCGACATCGTCACGTTCGTGCACGGCCAGATCTCCAACAACGCCCGGCAGCCTTACGCCGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997680
ATGGCCGCCGCCGCCGCCCGCCCCCTCGTCACCGTGCAGTCCCTGGAGAACGATATGGCCACCGACGGAGGAGCCGCAGCCAACTGCCTGCCTCTTCCTGACGTAATGAAAGCCGCTATCCGCCCCGACATCGTCACGTTCGTGCACGGCCAGATCTCCAACAACGCCCGGCAGCCTTACGCCGTCTCCAAACGCGCCGGCCACCAGACCTCTGCCGAGTCCTGGGGTACCGGCCGTGCAGTCTCCCGTATCCCCCGTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779075.1
MAAAAARPLVTVQSLENDMATDGGAAANCLPLPDVMKAAIRPDIVTFVHGQISNNARQPYAVSKRAGHQTSAESWGTGRAVSRIPRVPGGGGSSRNQER

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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