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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003064`

染色体: Chr08 坐标: 30819548-30824077 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003064`
名称	SmilChr08G003064
描述	protein REVEILLE 8-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	30819548 - 30824077 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997659`
GeneID	`130997659`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997659`
原始查询	`SmilChr08G003064`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein REVEILLE 8-like
产物	protein REVEILLE 8-like
Arabidopsis	`AT3G09600` (RVE8) Homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820117] identity=64.2; qcov=1.02; evalue=4.71e-122; confidence=high
Rice	`Os02g0680700` - identity=59.1; qcov=0.891; evalue=1.08e-92; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding); PF24904 (RVE6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997659

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779042.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779042.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779042.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779042.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779042.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:30820147`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	B134,B33,B49,B74,C2,C32,C68,D10,D11,D2
`Chr8:30822713`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,C65,C70
`Chr8:30823016`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C10,C39
`Chr8:30823687`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779042.1

291 aa

146

291

Myb_DNA-binding

RVE6

PF00249 Myb_DNA-binding 31-76 aa PF24904 RVE6 205-262 aa

XP_057779044.1

285 aa

142

285

Myb_DNA-binding

RVE6

PF00249 Myb_DNA-binding 31-76 aa PF24904 RVE6 205-267 aa

XP_057779045.1

266 aa

133

266

Myb_DNA-binding

RVE6

PF00249 Myb_DNA-binding 31-76 aa PF24904 RVE6 186-248 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779042.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	31	76	8.2e-13	49.0	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057779042.1`	Pfam	`PF24904`	RVE6	Domain	205	262	5.5e-31	107.3	REVEILLE 6-like domain
`XP_057779044.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	31	76	7.8e-13	49.0	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057779044.1`	Pfam	`PF24904`	RVE6	Domain	205	267	5.5e-34	116.9	REVEILLE 6-like domain
`XP_057779045.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	31	76	7e-13	49.2	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057779045.1`	Pfam	`PF24904`	RVE6	Domain	186	248	4.9e-34	117.0	REVEILLE 6-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923062.1
AAAAATAAGAAGAGGAGAGAGAAAATATGGTGGGAAAATGTATACCTCAAAAACTCTATAGATTTATTAAACTGAAGTTTTAATGTTTGGAGAAACTGGGTACGACTTAATATGTGGCTTGCCTGCTGCGTCGTCACTTTCAAGCAGTTTTAATCAAGGACCTACATAATCGAACCCAAAAGGCTGGGCGCATGTGATTCATCTCACACGGGGGGCCACCAATGAGCCGATTAATCGTGCGCCTACCAAGTTGATTGGCT...

XM_057923061.1
AAATGTATACCTCAAAAACTCTATAGATTTATTAAACTGAAGTTTTAATGTTTGGAGAAACTGGGTACGACTTAATATGTGGCTTGCCTGCTGCGTCGTCACTTTCAAGCAGTTTTAATCAAGGACCTACATAATCGAACCCAAAAGGCTGGGCGCATGTGATTCATCTCACACGGGGGGCCACCAATGAGCCGATTAATCGTGCGCCTACCAAGTTGATTGGCTTATCTCACCCATAATCAATCGCACCAAACACGATG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130997659
ATGAATTCCAATCCGCCGCCTCCACCTCAGTCTCAGCTGTCCGACGCCTCCGGCAAGAAGATCCGAAAGCCCTACACCATTACCAAGTCCAGAGAAAGCTGGACGGAAGAAGAGCACGACAAGTTCCTCGAAGCACTCCAACTGTTCGACCGTGATTGGAAGAAAATTGAAGATTTTGTTGGCTCAAAGACAGTAATTCAGATTCGGAGTCATGCTCAGAAGTACTTTCTGAAGGTTCAGAAGAACGGAACAGTGGCTCA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057779042.1
MNSNPPPPPQSQLSDASGKKIRKPYTITKSRESWTEEEHDKFLEALQLFDRDWKKIEDFVGSKTVIQIRSHAQKYFLKVQKNGTVAHVPPPRPKRKASHPYPQKAPKNVLVPLQASVAYQSSSVNSIAHGYPTWEEASVLVNNAVPGSMPSENEYNYLGVEADIGSKGVSTISNCSMNAFGSSPRTTPTSELPNQGKQDSVVHGIPDFSEVYGFIGSVFDPESKDHVQKLKEMDPINFETVLLLMRNLTLNLSSPEFEPI...

XP_057779044.1
MNSNPPPPPQSQLSDASGKKIRKPYTITKSRESWTEEEHDKFLEALQLFDRDWKKIEDFVGSKTVIQIRSHAQKYFLKVQKNGTVAHVPPPRPKRKASHPYPQKAPKNVLVPLQASVAYQSSSVNSIAHGYPTWEEASVLVNNAVPGSMPSENEYNYLGVEADIGSKGVSTISNCSMNAFGSSPRTTPTSELPNQGKQDSVVHGIPDFSEVYGFIGSVFDPESKDHVQKLKEMDPINFETVLLLMRNLTLNLSSPEFEPI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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