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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003067`

染色体: Chr08 坐标: 30859635-30863355 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003067`
名称	SmilChr08G003067
描述	uncharacterized SmilChr08G003067
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	30859635 - 30863355 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997639`
GeneID	`130997639`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997639`
原始查询	`SmilChr08G003067`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0704400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=24.4; qcov=1.03; evalue=1.19e-54; confidence=weak
Rice	`Os06g0704400` - identity=35.6; qcov=1.02; evalue=3.28e-98; confidence=medium
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997639

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779015.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057779015.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779015.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779015.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779015.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:30860370`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B55
`Chr8:30860370`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B55
`Chr8:30860750`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,C78,C80
`Chr8:30860932`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	14	A1,A20,A25,A3,B37,B48,B55,B72,B77,B88,B9,C29,C71,C81
`Chr8:30860961`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr8:30861034`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B33,B80,C38
`Chr8:30861356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	33	A13,A16,B1,B103,B109,B112,B132,B24,B29,B3,B31,B57,B63,B67,B70,B72,B77,B8,B80,B83,C16,C19,C3,C42,C49,C51,C52,C57,C6,C65,C86,C87,D9
`Chr8:30861445`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B90
`Chr8:30861445`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B90
`Chr8:30861516`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B1,B63,B8,C51,C57

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779015.1

518 aa

259

518

MULE

Transposase_mut

SWIM

PF10551 MULE 187-283 aa PF00872 Transposase_mut 206-308 aa PF04434 SWIM 426-464 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779015.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	187	283	1.6e-15	58.0	MULE transposase domain
`XP_057779015.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	206	308	3.3e-07	30.2	Transposase, Mutator family
`XP_057779015.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	426	464	8.8e-08	32.2	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093134.1
TTTAGTTAAACTAAACACACTAGACATAAAAAAACACAAGCACGCAGACAAGCTTTTGGATTCTTCAAGAAATAGTCAAGCTTTTGGATTATTCAAGGGGAGGGAAAATAGACTCAACGTGGACTAATGGTTGACAGGTATATGCTTTTTTAATTTGTATTTGATCCTCGAATTTTTTAAAGCGATGGTTTATGTGGTATTAATAGGGTTTATGTGGTTTTAATAACATGCTGATACGAGATTAATTTGTGCATTCACAG...

XM_057923032.1
TTTAGTTAAACTAAACACACTAGACATAAAAAAACACAAGCACGCAGACAAGCTTTTGGATTCTTCAAGAAATAGTCAAGCTTTTGGATTATTCAAGGGGAGGGAAAATAGACTCAACGTGGACTAATGGTTGACAGGTATATGCTTTTTTAATTTGTATTTGATCCTCGAATTTTTTAAAGCGATGGTTTATGTGGTATTAATAGGGTTTATGTGGTTTTAATAACATGCTGATACGAGATTAATTTGTGCATTCACAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997639
ATGAAGTTTCAGGATGGATATCAAGCTAGAGAGGCTTTAAAAACTAATGCAATTGAGAATGGATGGCAAATTCACTTCAAAAGGGTAACTAAGAATCAAATGGAAGCATATTGCACATCACCTTGCAAGTGGAGGTGTTATGGGAGCTTGGTGACATTAGATGACTCTTTTATTATTAAGATTGTTGAGGGGGTTCATACTTGTCCTAGAGCTATGAGAAATAAACAGGTGAGTTCTAGTTGGATAGCTAAAAAATATCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779015.1
MKFQDGYQAREALKTNAIENGWQIHFKRVTKNQMEAYCTSPCKWRCYGSLVTLDDSFIIKIVEGVHTCPRAMRNKQVSSSWIAKKYLNVFRVRPEITVKELGKDILERYACHTTIWKLYKAKDKAIEQLRGSVEQHYAKLRSYILELLRVDREGRFELKLDVGAIFKGIYIGFSTLKKGFNVGCRRVIGLDGAFLKTYLGEVLLCAIGKDGNNQMFPIAWAVVEVENEACWKWFLQILMEELGLRDGLGITFISDQQKGL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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