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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；公开文献名称仅收录身份已有序列证据的记录。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003080`

染色体: Chr08 坐标: 31035714-31037939 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一基因 ID	`SmilChr08G003080`
名称	SmilChr08G003080
描述	probable rRNA-processing protein EBP2 homolog
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	31035714 - 31037939 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997653`
GeneID	`130997653`
locus_tag	`-`
NCBI 名称	`LOC130997653`
原始查询	`SmilChr08G003080`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable rRNA-processing protein EBP2 homolog
产物	probable rRNA-processing protein EBP2 homolog
拟南芥	`AT3G22660` (AT3G22660) rRNA processing protein-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821837] identity=61.46; qcov=0.952; evalue=1.25e-111; confidence=high
水稻	`Os07g0475800` (P0571D04.124) - identity=63.39; qcov=0.864; evalue=2.27e-97; confidence=high
GO	GO:0005730 (nucleolus); GO:0006364 (rRNA processing); GO:0030687 (preribosome, large subunit precursor); GO:0034399 (nuclear periphery); GO:0042273 (ribosomal large subunit biogenesis)
KEGG	-
Pfam	PF05890 (Ebp2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997653

打开注释模块

亚细胞定位候选（最多五项）

预测得分表示模型支持程度，不能作为定位概率；所有候选均需实验验证。

方法与数据说明

当前结果已使用全部46,325条核基因组蛋白的完整原生特征重算。逐条核验39×39×7 PROFEAT、1280维ESM2、整条序列及五组模型的定位判定；当前模型、阈值文件和执行种子有记录。历史缓存及历史执行版本仍未确认。结果为计算候选，预测得分表示模型支持程度，不是校准概率，也不代表实验确认或已建立的预测准确率。模型含部分动物相关标签，应谨慎解读其在植物中的适用性。四舍五入后概率与阈值相等的481条记录已按未舍入模型值再次复核，原始投票全部一致。

排序	定位位置	预测得分	蛋白 ID
1	细胞核	1.00000	`SmilChr08G003080.1`
2	核仁	1.00000	`SmilChr08G003080.1`
3	核仁周缘	0.40000	`SmilChr08G003080.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	参考等位基因	变异等位基因	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:31036859`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	4	B13,C8,D2,D7
`Chr8:31036859`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	4	B13,C8,D2,D7
`Chr8:31037068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B74,C73,C74
`Chr8:31037270`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B4,C36,C46,D7
`Chr8:31037348`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,C78,C80
`Chr8:31037557`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B130

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

SmilChr08G003080.1

来源蛋白: XP_057779032.1

319 aa

160

319

Ebp2

PF05890 Ebp2 71-317 aa

SmilChr08G003080.2

来源蛋白: XP_057779033.1

294 aa

147

294

Ebp2

PF05890 Ebp2 46-292 aa

蛋白 ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	得分	说明
`SmilChr08G003080.1` XP_057779032.1	Pfam	`PF05890`	Ebp2	Family	71	317	4e-66	223.9	Eukaryotic rRNA processing protein EBP2
`SmilChr08G003080.2` XP_057779033.1	Pfam	`PF05890`	Ebp2	Family	46	292	3e-66	224.2	Eukaryotic rRNA processing protein EBP2

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。蛋白及对应 CDS 使用“基因 ID.序号”；序号在当前参考发布内固定，来源 accession 同时保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923050.1
GGATATGTGACCCGACCCGAGTAATTGAGTAAAATTGTTTTCTCAAAAAACCCAATAAAAGTTGGAGAAATAAAATCTGATGCCTAGGGTTTTATTAGGGGTTTTCCATCCATTTTCTGCTTCAGCAGTCATCCAATTCCCTCTCCGTCTCTCTTCTACGGCGGCGCATACTAAGGTTACAAATCGTTAACCAGAAACGGCGCAATTCACGCCAGAAATCTCTCATCGACTCCCTTCTCTCACAGCAGCTGCTCCACACT...

XM_057923049.1
CGAGTAATTGAGTAAAATTGTTTTCTCAAAAAACCCAATAAAAGTTGGAGAAATAAAATCTGATGCCTAGGGTTTTATTAGGGGTTTTCCATCCATTTTCTGCTTCAGCAGTCATCCAATTCCCTCTCCGTCTCTCTTCTACGGCGGCGCATACTAAGGTTACAAATCGTTAACCAGAAACGGCGCAATTCACGCCAGAAATCTCTCATCGACTCCCTTCTCTCACAGCAGCTGCTCCACACTTTCGACCGCCACTCTGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

SmilChr08G003080.1 (XP_057779032.1)
ATGCCTGGTGCTGTTTTAGGTATCTTGACATCATTGTTTTTTGGTTGCTGTATAACAGGCCGTGTCGCAACAACGATGAAGAACGATCAACTATTGAACAGTAGTGGATCAGATATGGAAGATGATGATCCTGTTGTTTCTGAGTCTGAGTCTGAGTCTGAATCGGATGAAGATGGAGATGTAAAGTTGAGTGAGCCTTCAAAGACTGCTATAAATAACAAAGCTGGCTTACTTGATAAACTCGGAGATATCTGCTGGCC...

SmilChr08G003080.2 (XP_057779033.1)
ATGAAGAACGATCAACTATTGAACAGTAGTGGATCAGATATGGAAGATGATGATCCTGTTGTTTCTGAGTCTGAGTCTGAGTCTGAATCGGATGAAGATGGAGATGTAAAGTTGAGTGAGCCTTCAAAGACTGCTATAAATAACAAAGCTGGCTTACTTGATAAACTCGGAGATATCTGCTGGCCCGACAATGTGGACTGGATACACAAGTTGTCGCTTGATATTGATCAAGATCACGAGGTGAGTGTGAATGATGATCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

SmilChr08G003080.1 (XP_057779032.1)
MPGAVLGILTSLFFGCCITGRVATTMKNDQLLNSSGSDMEDDDPVVSESESESESDEDGDVKLSEPSKTAINNKAGLLDKLGDICWPDNVDWIHKLSLDIDQDHEVSVNDDLSRELAFYTQALEGARQAFTKFQTKEVDLPFLRPSDYYAEMVKSDTHMEKVKSRLLAEKRKMEEAEERRKARDNKKLAKEIQVQKQKERAKQKKDDIESVKNWRKQRKQSGFAAGDKDGDLSLAFEDGKAFERSSKKRPGVAPWDRSGG...

SmilChr08G003080.2 (XP_057779033.1)
MKNDQLLNSSGSDMEDDDPVVSESESESESDEDGDVKLSEPSKTAINNKAGLLDKLGDICWPDNVDWIHKLSLDIDQDHEVSVNDDLSRELAFYTQALEGARQAFTKFQTKEVDLPFLRPSDYYAEMVKSDTHMEKVKSRLLAEKRKMEEAEERRKARDNKKLAKEIQVQKQKERAKQKKDDIESVKNWRKQRKQSGFAAGDKDGDLSLAFEDGKAFERSSKKRPGVAPWDRSGGKAKQGGGKWNKGSDKKMKGRERKDS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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