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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003085`

染色体: Chr08 坐标: 31068551-31071862 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003085`
名称	SmilChr08G003085
描述	interactor of constitutive active ROPs 2, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	31068551 - 31071862 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997637`
GeneID	`130997637`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997637`
原始查询	`SmilChr08G003085`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	interactor of constitutive active ROPs 2, chloroplastic-like
产物	interactor of constitutive active ROPs 2%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT2G37080` (RIP2) ROP interactive partner 3 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818284] identity=43.7; qcov=1.09; evalue=5.32e-126; confidence=medium
Rice	`Os05g0122600` - identity=38.2; qcov=1.08; evalue=3.52e-96; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF27682 (ICR5_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997637

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoskeleton	细胞骨架	0.80000	`XP_057779012.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057779012.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057779012.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779012.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779012.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:31068862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B15,C15
`Chr8:31068964`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr8:31068966`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D10
`Chr8:31068966`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D10
`Chr8:31068969`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:31069366`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr8:31069440`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B56,B96,D11,D4
`Chr8:31069780`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B120
`Chr8:31069886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:31070128`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:31070254`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr8:31070353`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B120,B62,C31,C41,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779012.1

570 aa

285

570

ICR5_C

PF27682 ICR5_C 405-509 aa

XP_057779013.1

570 aa

285

570

ICR5_C

PF27682 ICR5_C 405-509 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779012.1`	Pfam	`PF27682`	ICR5_C	Domain	405	509	1.9e-24	87.2	Interactor of constitutive active ROPs 5 C-terminal domain
`XP_057779013.1`	Pfam	`PF27682`	ICR5_C	Domain	405	509	1.9e-24	87.2	Interactor of constitutive active ROPs 5 C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923030.1
GTTTGTTATTATTAGTCTTCTTTTTCAATTTCCAGTAAGACTTAAAATAACTAAGGCAAGGGAACGCAGAGGCTGCCAACTGCAGCTAGCGCATCAGCTGCTCTCTCTCTCTCTCTCTCAAGAGTTCTTGAGACTCAACGTGGTTGTGGGCTCAGGTGGCCCTCTGAGTGCTTGTTGCTTTCTATATCATCGTCTTCGCTCATCCGTCTCAAATATGCAGACCACTACATCAAGAGGTGGTGGTGGTTCCGCGCTTCAGA...

XM_057923029.1
ATACTGTCGTCTTGTTTATTTTTCTCCTCTGTTGGCTAAACTTTTCCTCTTCTTCAACTTCTGGTTTACTAAAATTTTAGGAACAACTTTTATGGAGTATGATCTTTTGCATGTCAATAAAGAAAAAAACTTCTTGCTACAATATATATTACAGTGATCCCACCACTTGATTCATGCCTCTTCTTCAACTAGTCATGTACACACACACACACACACACATATATATATATACACTATATTGCCGTTTCTGTGTGTGTCTG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997637
ATGCAGACCACTACATCAAGAGGTGGTGGTGGTTCCGCGCTTCAGAACGCCAGGAAGCTCAAAACTGCCGCATCAGATTCTACTTGTGTTTCTTCTCCAAATCCGATTATCAAAACAGCCAAGGATCGAAGTCTTAAAACCATTGATCGCAGATTACCGCGTGCTCCAGTTACTGAGAAAAAGAGGCCGAACAAACCGTCTGAATCAGAGGCTCGGATCGCGCAGCTCCAAGAGGATCTGAAGAAGACGAAGGAGCAGCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057779012.1
MQTTTSRGGGGSALQNARKLKTAASDSTCVSSPNPIIKTAKDRSLKTIDRRLPRAPVTEKKRPNKPSESEARIAQLQEDLKKTKEQLSSSESWKRRAQQEAEEGRKQLAAMAAELEESRNQLKELSECEEARLQELRKISQERDREWQSELEAFQKQYSMDSAALSSAMNEIQKLKMQLDRVSQSEAAQARHAESAHAEIQSLRVELTETLLLVDRLKTQLNDSRDYESHALDEVSRAETQLQVVKTAENELKLEHDNVV...

XP_057779013.1
MQTTTSRGGGGSALQNARKLKTAASDSTCVSSPNPIIKTAKDRSLKTIDRRLPRAPVTEKKRPNKPSESEARIAQLQEDLKKTKEQLSSSESWKRRAQQEAEEGRKQLAAMAAELEESRNQLKELSECEEARLQELRKISQERDREWQSELEAFQKQYSMDSAALSSAMNEIQKLKMQLDRVSQSEAAQARHAESAHAEIQSLRVELTETLLLVDRLKTQLNDSRDYESHALDEVSRAETQLQVVKTAENELKLEHDNVV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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