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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003090`

染色体: Chr08 坐标: 31111109-31112218 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003090`
名称	SmilChr08G003090
描述	uncharacterized SmilChr08G003090
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	31111109 - 31112218 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998319`
GeneID	`130998319`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998319`
原始查询	`SmilChr08G003090`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os01g0872900; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=35.8; qcov=0.8; evalue=3.95e-39; confidence=medium
Rice	`Os01g0872900` - identity=49.2; qcov=1.06; evalue=2.64e-119; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF13359 (DDE_Tnp_4); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998319

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779730.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057779730.1`
3	Telomere	端粒	0.20000	`XP_057779730.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779730.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779730.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:31111109`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B57,C18,C62,C81
`Chr8:31111148`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	84	A16,A22,A23,A25,A4,A8,B1,B10,B104,B11,B110,B112,B114,B122,B123,B128,B131,B137,B138,B14,B140,B16,B2,B21,B22,B29,B3,B32,B4,B40,B45,B46,B47,B53,B55,B57,B58,B59,B60,B63,B68,B73,B8,B82,B87,B91,B93,B94,B97,B99,C11,C12,C14,C16,C17,C18,C22,C23,C26,C28,C3,C32,C36,C38,C4,C40,C42,C43,C46,C48,C51,C52,C61,C62,C63,C67,C68,C69,C7,C82,C86,D11,D5,D7
`Chr8:31111159`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B104,B23,B62,C60
`Chr8:31111208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,A5,B136
`Chr8:31111230`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,C5,D9
`Chr8:31111233`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B101
`Chr8:31111244`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr8:31111269`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr8:31111286`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	140	A1,A10,A11,A15,A18,A2,A21,A23,A24,A3,A5,A7,B100,B101,B102,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B113,B114,B117,B119,B12,B120,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B13,B130,B132,B133,B135,B136,B138,B139,B17,B18,B2,B20,B23,B25,B27,B28,B30,B38,B39,B4,B42,B43,B46,B48,B5,B50,B51,B54,B55,B56,B6,B65,B66,B70,B71,B72,B75,B76,B77,B78,B79,B81,B84,B85,B87,B88,B9,B93,B95,B96,B97,C1,C10,C11,C13,C14,C15,C17,C19,C2,C20,C21,C22,C25,C27,C28,C29,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C45,C47,C48,C55,C58,C60,C61,C62,C64,C65,C66,C69,C70,C71,C74,C75,C77,C78,C8,C80,C81,C83,C84,C85,C9,D10,D11,D2,D3,D4,D6,D7,D8,D9
`Chr8:31111296`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B65,C5,D9
`Chr8:31111312`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr8:31111377`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A15,B33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779730.1

335 aa

168

335

DUF8418

Plant_tran

DDE_Tnp_4

PF28509 DUF8418 1-35 aa PF04827 Plant_tran 70-273 aa PF13359 DDE_Tnp_4 101-264 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779730.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	1	35	9.9e-16	57.9	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057779730.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	70	273	1.8e-93	312.6	Plant transposon protein
`XP_057779730.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	101	264	2.8e-12	47.2	DDE superfamily endonuclease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923747.1
ATGAGGGATTATTTTGATGAAAATCCAACATGGGGTCCCAACGTATTTAGGCGGCATTTTCGGATGCGGAAAGAGTTATTCACTCGCATAGTGAATGCCTTGGAAGCCAACAACACATGGTTTCAACAAAGACCCGATGCCACAGGGAAGAAAGGGTACGAGTGCTTGCGCCACTTCTGCCGAGGTGTTATTGAGGTTTTCGGTGCACACTACTTGAGGAGGCCAACCGTTGATGACTATCAGCGTTTGATGAAAATGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998319
ATGAGGGATTATTTTGATGAAAATCCAACATGGGGTCCCAACGTATTTAGGCGGCATTTTCGGATGCGGAAAGAGTTATTCACTCGCATAGTGAATGCCTTGGAAGCCAACAACACATGGTTTCAACAAAGACCCGATGCCACAGGGAAGAAAGGGTACGAGTGCTTGCGCCACTTCTGCCGAGGTGTTATTGAGGTTTTCGGTGCACACTACTTGAGGAGGCCAACCGTTGATGACTATCAGCGTTTGATGAAAATGCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779730.1
MRDYFDENPTWGPNVFRRHFRMRKELFTRIVNALEANNTWFQQRPDATGKKGYECLRHFCRGVIEVFGAHYLRRPTVDDYQRLMKMHEQRHGFPGMLESLDCIHWTWKNCLVAWKCQFTNGDHGVPTIMLEVVASQDLWIWHVFFGVAGSNNDINVLNQSPLFNVVLQGRAPSIPFTVNGTQYAHGYYLTDGKYPEWTTFVKSFQHPQDPKRRKFKEMQEAARKDVERTFGVLQARWAMIRGPSRLWYKENITDIMYACI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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