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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003093`

染色体: Chr08 坐标: 31132455-31134150 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003093`
名称	SmilChr08G003093
描述	beta-1,4-xylosyltransferase IRX9
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	31132455 - 31134150 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997684`
GeneID	`130997684`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997684`
原始查询	`SmilChr08G003093`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	beta-1,4-xylosyltransferase IRX9
产物	beta-1%2C4-xylosyltransferase IRX9
Arabidopsis	`AT2G37090` (IRX9) Nucleotide-diphospho-sugar transferases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818285] identity=54.9; qcov=1.06; evalue=6.16e-132; confidence=high
Rice	`Os05g0123100` (OsGT43A) - identity=43.5; qcov=1.06; evalue=2.87e-78; confidence=medium
GO	GO:0000139 (Golgi membrane); GO:0009834 (plant-type secondary cell wall biogenesis); GO:0010417 (glucuronoxylan biosynthetic process); GO:0015018 (galactosylgalactosylxylosylprotein 3-beta-glucuronosyltransferase activity); GO:0042285 (xylosyltransferase activity)
KEGG	-
Pfam	PF03360 (Glyco_transf_43)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997684

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057779079.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057779079.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779079.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779079.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779079.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:31132776`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A8,B133,B53
`Chr8:31132830`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B41,C64
`Chr8:31132837`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr8:31133225`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:31133255`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:31133486`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,B39
`Chr8:31133494`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr8:31133647`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,D2
`Chr8:31133648`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B4,C36,C46,D7
`Chr8:31133685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B12,B133,B53
`Chr8:31133723`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B24,B79,B91

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779079.1

325 aa

162

325

Glyco_transf_43

PF03360 Glyco_transf_43 120-324 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779079.1`	Pfam	`PF03360`	Glyco_transf_43	Family	120	324	2e-56	191.8	Glycosyltransferase family 43

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923096.1
CAAAAAAAGCAATATTTATTTCCTGTATTTCTTACATTTCAAGGCATGACTCTGGCAAGCAAGGCCTCACCAATTATGTGGTTTCTGTTCACTACACCTTCACCATGAATTATTAATAGTTAGCTCAATCCCTCTCATTTCTAAGAACCTATATCGTTTCCATTCTTGGATTTTCATCCATGAATCCTCTCCCAGAATACATCTTCTTCCCCAAGATCCTCCTTGAAGCAAGTACTCACTGAAGCACATCTCCTAGAACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997684
ATGGGATCTTTGGATAGATCAAAGAAGAAGGTGCACTTATGGAAGAAAGCCGCGGTCCATTTCTTGCTCTGTTTCATGATGGGGTTCTTCACCGGCTTCGCCCCAAACAGAAAAACCTCAATTTCATCCGGTAATGCCACAATGTCGCCACAGCCGGTTGAGGCGTTTCATCAAGAGAAAACGCGGAATTTCAACATAAGCTTGCTGGTCGAAGCAGCAGAACCAGCTGAGGAAGAGCAGAATAACAACCCTCAGCAAGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779079.1
MGSLDRSKKKVHLWKKAAVHFLLCFMMGFFTGFAPNRKTSISSGNATMSPQPVEAFHQEKTRNFNISLLVEAAEPAEEEQNNNPQQEKEETEELDIRRLVIVITPMSTRNKLRGPLLRRLASTLKLVAQPLLWIVVEQQPEDSEVSETLRRSGIMYRHVVFKENFTDTTSEMDFQRNVALNHIEHHRLTGIVHFAGLSNVYDLAFFEEIRAVEGFGAWPIAKLSANRKKVVIEGPVCDSSEVVGWHLKKMNNVTDATPLP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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