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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003094`

染色体: Chr08 坐标: 31134501-31136368 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003094`
名称	SmilChr08G003094
描述	protein OSB2, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	31134501 - 31136368 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997642`
GeneID	`130997642`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997642`
原始查询	`SmilChr08G003094`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein OSB2, chloroplastic-like
产物	protein OSB2%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT4G20010` (PTAC9) plastid transcriptionally active 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827746] identity=37.9; qcov=0.811; evalue=1.54e-66; confidence=medium
Rice	`Os01g0949060` (B1147A04.4-2) - identity=31.4; qcov=0.85; evalue=2.21e-48; confidence=low
GO	GO:0003697 (single-stranded DNA binding); GO:0006264 (mitochondrial DNA replication); GO:0042645 (mitochondrial nucleoid); GO:0051096 (positive regulation of helicase activity)
KEGG	-
Pfam	PF30937 (OSB_PDF); PF30940 (OSB_SSB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997642

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057779018.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057779018.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779018.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779018.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779018.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:31134863`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C44
`Chr8:31134863`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C44
`Chr8:31134918`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:31135167`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B103,B62
`Chr8:31135173`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr8:31135238`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B90
`Chr8:31135605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr8:31135663`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B126
`Chr8:31135663`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B126
`Chr8:31135868`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,C78,C80
`Chr8:31135902`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:31135921`	`TGC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	115	A11,A13,A14,A18,A2,A22,A23,A4,A5,A7,A9,B1,B10,B101,B103,B105,B107,B108,B11,B115,B120,B122,B124,B125,B132,B134,B135,B138,B18,B24,B26,B3,B30,B33,B35,B39,B40,B41,B42,B43,B45,B46,B47,B48,B50,B52,B56,B6,B60,B61,B64,B66,B70,B71,B72,B75,B76,B77,B79,B81,B83,B87,B89,B9,B90,B93,B94,B96,B97,B99,C1,C10,C13,C18,C20,C21,C24,C26,C27,C28,C30,C34,C37,C4,C40,C44,C45,C46,C47,C50,C51,C54,C58,C59,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C7,C71,C73,C74,C77,C78,C84,C9,D1,D2,D3,D6,D7,D8,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779018.1

439 aa

220

439

OSB_SSB

OSB_PDF

PF30940 OSB_SSB 95-193 aa PF30937 OSB_PDF 298-353 aa PF30937 OSB_PDF 383-432 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779018.1`	Pfam	`PF30940`	OSB_SSB	Domain	95	193	3.6e-32	111.2	OSB SSB domain
`XP_057779018.1`	Pfam	`PF30937`	OSB_PDF	Repeat	298	353	1.8e-45	152.9	OSB PDF repeat
`XP_057779018.1`	Pfam	`PF30937`	OSB_PDF	Repeat	383	432	1.8e-45	152.9	OSB PDF repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923035.1
TTGAAATTATCGACTTTAATAACCTATAGAAAATTATGCAAATCTATTACTCACTTCCACTGAGAAGTGTACCTAATATTTGTTTTAGACAAACGAAACGACTGCTACATTCGCATCGAACAACTCAATGCACTCTCATCACTCCCGTTATCCTATTCCTATACAAAAAACCCCAAAATCCCTCTCCAAACCCTAAATCACACGCATAGATCTCTGAACCAATCCTCAAACTTGCGATGAATCTACTAACCGGAGCAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997642
ATGAATCTACTAACCGGAGCAAAACAATCAGCCCGCCTTGTTTTCTCGTCTCCCTCGTCAACTAGACGCCTGTTTCACCTTCACCCTGTTGCTGCTCTTCAGCATTGCAATTTCTACTCCACCAAAGCTGCTAGTACAATCCAGAAGACTCAAAAGGCGACCAAGCCCAGAACCCAGCAGAAAGCTTCTGAAAAATCGTTTAGTTTCGCGCAGACTATCAAGAAACAAGCGGAGGCGCCGCCTGCTCTCTGGCCTAAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779018.1
MNLLTGAKQSARLVFSSPSSTRRLFHLHPVAALQHCNFYSTKAASTIQKTQKATKPRTQQKASEKSFSFAQTIKKQAEAPPALWPKPQPISYQAEVANNVNFIGNVDIPVKFVTDSDGKHFTVTVISLRRGDGRGSLSIPVVFEGDLAHVAACHVKENDCVFVSGQLSGDPLRCALSESLGKFHVVAESVNFVEEFEKSDLDSKLGISSPAVDINGLGRVKSKNVDHVDYNQISQVEFDGAKERSSSIERPAVPLYEAET...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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