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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003105`

染色体: Chr08 坐标: 31297168-31299908 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003105`
名称	SmilChr08G003105
描述	L-type lectin-domain containing receptor kinase VIII.1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	31297168 - 31299908 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997695`
GeneID	`130997695`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997695`
原始查询	`SmilChr08G003105`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	L-type lectin-domain containing receptor kinase VIII.1-like
产物	L-type lectin-domain containing receptor kinase VIII.1-like
Arabidopsis	`AT3G53380` (AT3G53380) Concanavalin A-like lectin protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824506] identity=64.2; qcov=0.971; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0125200` - identity=54.1; qcov=0.989; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006468 (protein phosphorylation); GO:0030246 (carbohydrate binding)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00139 (Lectin_legB); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997695

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057779081.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779081.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779081.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779081.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779081.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:31297504`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B123,B14,C8,D2,D7
`Chr8:31297605`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C11,C39,C69
`Chr8:31297611`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr8:31297619`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B37,C53
`Chr8:31297619`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B37,C53
`Chr8:31297622`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr8:31297643`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr8:31297660`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr8:31297667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,B42
`Chr8:31297749`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B105,B51,B75,C35
`Chr8:31297881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:31297914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779081.1

712 aa

356

712

Lectin_legB

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00139 Lectin_legB 33-269 aa PF00069 Pkinase 386-648 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 388-650 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779081.1`	Pfam	`PF00139`	Lectin_legB	Domain	33	269	1.5e-61	208.8	Legume lectin domain
`XP_057779081.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	386	648	5.5e-48	164.4	Protein kinase domain
`XP_057779081.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	388	650	3.4e-45	155.1	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923098.1
GTTCAATTATGTGTGCACATATGTGCATTTATCATTATTCTTAATTATATCACGTCATGAACGAGCATTCGGCATTCCATATTCTGCGAAATGATTCCATAACTAAAAAGGAAAACAATAAAAGTAAAAATCTGACAGCGAGAATAAAATTGCAACCTTGGAAAGTGCAAAACCACTTTCCATCCTGCCCGAAAAAATAATTTGCTTTAAACGGTGTTTTTTATGACAACCGACCGACCTCAGAAAATATTACCGTTGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997695
ATGACGTCATTTCCCGGCGGGCTGTGCTACTGCTTCATTCTCCTATCTGTTTTCGCTTCGGTCGGGTTTTTCTCCGGCAATGTATTGGCTGCGGCGACTGAATTCGACTTCGGAACACTGACGCTGTCCAGCATGAAGCTCCTCGGCGACGCCCACTTCAGCAACGGGAGCGCGAGGCTCACTCGCGACGTCACCGTCCCGTACTCCGGCGCCGGGAGGGTGCTATACTCGAAGCCGGTCAGTTTCCGGCGTCCAGGTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779081.1
MTSFPGGLCYCFILLSVFASVGFFSGNVLAAATEFDFGTLTLSSMKLLGDAHFSNGSARLTRDVTVPYSGAGRVLYSKPVSFRRPGSRSTASFSTFFSFSVTNLNPSSIGGGLAFVISPDDEFVGDAGGFLGLMEAEGAPNGVVAVEFDTMMDVEFKDINGNHVGLDLNSMISSRVTDLGVVGVDLKSGDLVNSWVDYSGSNRTIKVYVSYSNLKPKEPVLSAAVDLGEYISDDFMFVGFSGSTQGSTEVHSIEWWSFAS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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