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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003110`

染色体: Chr08 坐标: 31351785-31353137 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003110`
名称	SmilChr08G003110
描述	uncharacterized SmilChr08G003110
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	31351785 - 31353137 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997701`
GeneID	`130997701`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997701`
原始查询	`SmilChr08G003110`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	DUF1685 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818876]; symbol=AT2G42760; hit=AT2G42760; species=arabidopsis; confidence=low
产物	DUF1685 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818876]; symbol=AT2G42760; hit=AT2G42760; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G42760` (AT2G42760) DUF1685 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818876] identity=36.9; qcov=0.562; evalue=1.25e-16; confidence=low
Rice	`Os06g0550800` - identity=33.8; qcov=0.613; evalue=2.3e-12; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997701

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057779084.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057779084.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057779084.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.40000	`XP_057779084.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779084.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:31352060`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	A16,A18,A9,B109,B11,B113,B33,B4,B43,B46,B56,B68,B75,B80,B90,B91,B99,C15,C41,C57,C87
`Chr8:31352067`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr8:31352128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr8:31352144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B104,B88,B90,C41
`Chr8:31352170`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B75
`Chr8:31352278`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B109,C68
`Chr8:31352344`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B113,C32
`Chr8:31352350`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C68
`Chr8:31352355`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	4	B113,B90,C32,C56
`Chr8:31352355`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	4	B113,B90,C32,C56
`Chr8:31352360`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	B113,B90,C32,C56
`Chr8:31352360`	`T`	`TCC`	2bp_insertion	CDS_variant	4	B113,B90,C32,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923101.1
ATGAGATCCCCACAAGGGTTGAAGGCGAAATAAGAGATGGAGGAGTTTGAGGCATGTGTGTAATGTGGAAATTGGATGGTTGCAGACCACATCTACCATTGTCTACGACCCCTCCACATTCAATTTGCATTTTCATATATTGAGATTCTTTTTCTTTCTTTTTTGGTTGAGAAATTCATTTATTGATTTTACCACCACAAGACAACCCTATCATCATCATCATCATTGCTCAAATATTTATTCTGCCAGCCAACACCTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997701
ATGGCAGCAGAGAAATCCACGGTATGCCTAGTCGCAGTGATGGACCGTCTCTGGTTTCACCAGATTATTCTTTTCGCAGAGACGCCGTCGTTTCGCGCCGCCGAAGATGTCAAAACCCTCATTCATTCATCAAAATTCACTTCCCAAATGCAAGAAATCTCTCCACTAGATGAGATTAGCAGCGAAGAAAGCGATGATTTCGAGAAGGAAACTGACGACGAAATACCGACGAGGTTAAATCTAAACCTAAACCTGGTCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779084.1
MAAEKSTVCLVAVMDRLWFHQIILFAETPSFRAAEDVKTLIHSSKFTSQMQEISPLDEISSEESDDFEKETDDEIPTRLNLNLNLVSGKGRCQSSSPISAQKRWRNHPSLKKSVSCKRLVDLELEEVKGFMDLGFIFRRENLTKRIIHLVPGLQRIGWSEHHSGNEIIRPYLSEAWAVRSPNSPLLNLRIPAASTAADMKKHLKYWAHTVASAIHQH

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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