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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003118`

染色体: Chr08 坐标: 31431857-31432816 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003118`
名称	SmilChr08G003118
描述	glutathione S-transferase T3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	31431857 - 31432816 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998322`
GeneID	`130998322`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998322`
原始查询	`SmilChr08G003118`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glutathione S-transferase T3-like
产物	glutathione S-transferase T3-like
Arabidopsis	`AT3G47680` (AT3G47680) DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922] identity=33; qcov=0.809; evalue=4.79e-22; confidence=low
Rice	`Os01g0527900` - identity=28.1; qcov=0.624; evalue=1.98e-15; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998322

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779732.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779732.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779732.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779732.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779732.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:31431872`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	29	A1,A7,B120,B125,B126,B129,B136,B14,B18,B27,B47,B53,B54,B80,B97,C3,C31,C4,C45,C5,C55,C58,C64,C67,C68,C73,C75,C78,D8
`Chr8:31431910`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C32,C60,C68,C9
`Chr8:31431922`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	18	B10,B107,B121,B28,B3,B45,B53,B62,B69,B7,B83,B97,C21,C27,C34,C59,C8,C81
`Chr8:31431927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr8:31431982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,C17,C46,C57
`Chr8:31432017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A5,B22,B61,B71
`Chr8:31432028`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B123
`Chr8:31432028`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B123
`Chr8:31432040`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	B137,B21,B32,B76,B86,C25,C39,C57
`Chr8:31432053`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C2,C48
`Chr8:31432089`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	8	B15,B29,B88,B95,C32,C68,C71,C87
`Chr8:31432111`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B107,B40,B62,B99

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923749.1
ATGCCACCACAATCTCAATTTTTTTCTTCCCCAACAACACAACATGCATCTAACGAGCAATCGTTTGGTTCTCTACCTTTCAACCCTCAACAATTTGGTTCTCTCTCTTTCAACTCTCAAACCTTCACATCTCAACCTTTCACTTCTCAACCCTTTGCCTCTCAAATTCCATCACATTGTACACAAATTAACCTCACTGATGCTGATGATGTTGTCGAAATTCCCACAAGCACAAAAAAATCAAAGAGAAAATGGTCTGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998322
ATGCCACCACAATCTCAATTTTTTTCTTCCCCAACAACACAACATGCATCTAACGAGCAATCGTTTGGTTCTCTACCTTTCAACCCTCAACAATTTGGTTCTCTCTCTTTCAACTCTCAAACCTTCACATCTCAACCTTTCACTTCTCAACCCTTTGCCTCTCAAATTCCATCACATTGTACACAAATTAACCTCACTGATGCTGATGATGTTGTCGAAATTCCCACAAGCACAAAAAAATCAAAGAGAAAATGGTCTGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779732.1
MPPQSQFFSSPTTQHASNEQSFGSLPFNPQQFGSLSFNSQTFTSQPFTSQPFASQIPSHCTQINLTDADDVVEIPTSTKKSKRKWSVSEEICLAQAWGTISNSSIVGNAQKNKEFWEKTVEYYNAARPKDSEPRKWEAIKSHYYHIMPDVNIFSGWYNNFYENRASGQSDEDVLDATLEKWRSVNPKKEFKYQHVWKIMRDLEKWAPQQMARHASKKAKTSESESHTSTEGMPEVRRRPMGQQRAKKLDKSKGKGKVVEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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