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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003119`

染色体: Chr08 坐标: 31435608-31437266 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003119`
名称	SmilChr08G003119
描述	uncharacterized SmilChr08G003119
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	31435608 - 31437266 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998323`
GeneID	`130998323`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998323`
原始查询	`SmilChr08G003119`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0439900; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os03g0439900` - identity=29; qcov=0.306; evalue=3.23e-13; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998323

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779733.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057779733.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057779733.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779733.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779733.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:31435624`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr8:31435629`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	30	A1,A22,A3,A4,B100,B101,B102,B120,B139,B22,B4,B44,B54,B55,B62,B72,B73,B77,B85,B88,B9,C24,C29,C31,C41,C64,C66,C71,C75,C9
`Chr8:31435652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B133
`Chr8:31435662`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B133,B56,D8
`Chr8:31435667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr8:31435679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B56
`Chr8:31435698`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B31,B33,C53,C9
`Chr8:31435728`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B133
`Chr8:31435766`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr8:31435800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr8:31435806`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C81
`Chr8:31435826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B70,C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779733.1

552 aa

276

552

PEG10_N-capsid

PF03732 PEG10_N-capsid 101-173 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779733.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	101	173	7.4e-13	49.4	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923750.1
ATGTGTGATGCCCCAACAAGACAACTAGAGGGACCGAGGCGAGCGATTCCAATCGGTCAGAATGGCAACACGCCAGATCAACCACCTCTTGGTGATCAGAGCCGACATGGCATGTTCAACGCCACCCAGAACTTGGATCCCACCTTGGCTAGAAGGTTGGCAGCTATGGAGACCATCATTCAACGAATCTCGGGAGTTCCGGCTCCGATAAAGAAAAGCGCAGAGAGTTGTTACGCCGACTCCCCATTCGTGGATGAGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998323
ATGTGTGATGCCCCAACAAGACAACTAGAGGGACCGAGGCGAGCGATTCCAATCGGTCAGAATGGCAACACGCCAGATCAACCACCTCTTGGTGATCAGAGCCGACATGGCATGTTCAACGCCACCCAGAACTTGGATCCCACCTTGGCTAGAAGGTTGGCAGCTATGGAGACCATCATTCAACGAATCTCGGGAGTTCCGGCTCCGATAAAGAAAAGCGCAGAGAGTTGTTACGCCGACTCCCCATTCGTGGATGAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779733.1
MCDAPTRQLEGPRRAIPIGQNGNTPDQPPLGDQSRHGMFNATQNLDPTLARRLAAMETIIQRISGVPAPIKKSAESCYADSPFVDEIALVEMPRKFSFPHMKMFDGASDPDDHIAQYRQKMFTVAIPRDMREACMCKGFSSSLIGPALQWYTNFPNNSIRSFAQLTDVFVQQYASSKKLEKISEDLYAVVQRHGEPLRDYIGRFNKEKVSITNCSKQTAVTTFCKGLLPGLDLYKTLTKYPCKTMEDVLIQAWAQIKWEE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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