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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003124`

染色体: Chr08 坐标: 31558538-31559621 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003124`
名称	SmilChr08G003124
描述	fasciclin-like arabinogalactan protein 11
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	31558538 - 31559621 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997714`
GeneID	`130997714`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997714`
原始查询	`SmilChr08G003124`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	fasciclin-like arabinogalactan protein 11
产物	fasciclin-like arabinogalactan protein 11
Arabidopsis	`AT5G03170` (FLA11) FASCICLIN-like arabinogalactan-protein 11 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831914] identity=62; qcov=0.816; evalue=1.36e-79; confidence=high
Rice	`Os05g0163300` (OsFLA9) - identity=51.9; qcov=0.757; evalue=3.67e-51; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF02469 (Fasciclin)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997714

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057779111.1`
2	Cell wall	细胞壁	0.20000	`XP_057779111.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779111.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779111.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779111.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:31558762`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C36
`Chr8:31558774`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr8:31558846`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B61
`Chr8:31558877`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B18
`Chr8:31558877`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B18
`Chr8:31558898`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr8:31558924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C9
`Chr8:31558985`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C15
`Chr8:31558995`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4
`Chr8:31559041`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,B101
`Chr8:31559062`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr8:31559296`	`G`	`GGA`	2bp_insertion	frameshift_variant	7	B30,B65,B76,B88,C64,C66,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779111.1

239 aa

120

239

Fasciclin

PF02469 Fasciclin 49-182 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779111.1`	Pfam	`PF02469`	Fasciclin	Domain	49	182	1.3e-22	81.0	Fasciclin domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923128.1
ATTAATATTAAATGGCGTACATATAAACACGATCACGATATGTAGTGACCAGAGTATTGAAATCGAAGTGACCATTTATTGAATTTTAAAAGTGGACATACCAAATGCCATTACTCAATATAAACCAAGAGACAAGGTGGTCTTCAAATTCTACCTCAAAGCAATGAAACCACAACTCTCCACATTCCCTCTCATCCTCCTCGTCTCCATCTGCTGCACCCTAACACGGGGACAGTCCCCGGCTGCAGCCCCATCCCCGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997714
ATGAAACCACAACTCTCCACATTCCCTCTCATCCTCCTCGTCTCCATCTGCTGCACCCTAACACGGGGACAGTCCCCGGCTGCAGCCCCATCCCCGGCCCCCGCAGGCCCCACGAACGTGACGGCCATCCTGGAGAAGGCCGGGCAGTTCGGCACATTCATCCGCCTCCTGCAGAACACGAAAGTAGCGGACCAGATAAACACGCAGCTCAACAGCTCCAAGCAAGGCGTCACCATCTTCGCCCCCACCGACAGCTCCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779111.1
MKPQLSTFPLILLVSICCTLTRGQSPAAAPSPAPAGPTNVTAILEKAGQFGTFIRLLQNTKVADQINTQLNSSKQGVTIFAPTDSSFSNLKAGTLNSFSDEQKVELMQFHVLPSVFSPSQFQTASNPMRTQAGGSQGSYPLNVTASGNQVNITTGVTNATVAGTVYTDAQLAVYQVDHVLLPLSFFTTLSPAPSPSKPGKAAPAPDSPPGSDATPDSSHANVITTKMVACAILFLAAFA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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