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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003125`

染色体: Chr08 坐标: 31588169-31595354 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003125`
名称	SmilChr08G003125
描述	uncharacterized SmilChr08G003125
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	31588169 - 31595354 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997715`
GeneID	`130997715`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997715`
原始查询	`SmilChr08G003125`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818292]; symbol=AT2G37160; hit=AT2G37160; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818292]; symbol=AT2G37160; hit=AT2G37160; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G37160` (AT2G37160) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818292] identity=74.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0172500` (OsWD40-195) - identity=67.4; qcov=0.971; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997715

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057779113.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057779113.1`
3	Vesicle	囊泡	0.60000	`XP_057779113.1`
4	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057779113.1`
5	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057779113.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:31589481`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B79
`Chr8:31589685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr8:31589701`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,C15,C31
`Chr8:31589949`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B40
`Chr8:31589981`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B124,B59
`Chr8:31591630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59
`Chr8:31592678`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C15
`Chr8:31592861`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,D11
`Chr8:31594640`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr8:31594715`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B84,C60,D10
`Chr8:31594898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779113.1

550 aa

275

550

WD40

PF00400 WD40 302-330 aa PF00400 WD40 347-372 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779113.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	302	330	6.5e-14	52.5	WD domain, G-beta repeat
`XP_057779113.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	347	372	6.5e-14	52.5	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923130.1
GTTTGTAGTTACCAACTCCTAAAAAAGTCAATACACAATTAATATCTCAAATCTCAATCTTAGAGCTTTCCTTTCAGTATACTCTCACACACAAAACGGTTTCTCTCTCTCCCACACACATAAAAGAAAGAGAGCTGAGAAATTAATGGGAAAAGAAAAAAAGGTAAAAAACCCTTGATACGTACACACACAGACGCGCACAACAACACAAACTGTTTCCACCCCCTAGCATTTAAGCACAACCCAGAAACCCAGCTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997715
ATGATGAACAGTGGGGCGAGTAACAATATGATGTCGTCGTCGGCGGCGTCGGCGTCTGGGAGCAACGCGCCGGGCCCTGGTTTGAAGACGTATTTCAAGACGCCAGAAGGTAAATATAAGCTCCAGTACGAGAAGACTCATCCCGCCGGTCTACTTCACTACGCCCATGGCAAAACAGTCACTCAGGTGACGCTAGCTCATCTTAAGGAAAAGCCAATGCAGGCACTGTCACAATCATCATCTACTTTAAATGTAAGCAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779113.1
MMNSGASNNMMSSSAASASGSNAPGPGLKTYFKTPEGKYKLQYEKTHPAGLLHYAHGKTVTQVTLAHLKEKPMQALSQSSSTLNVSSGVRSAAARLLGGSNGSRALSFVGGNGGSKPVGSSSTRIGSLGASSSNNVVGNPNFDGKGTYLVFNVGDAIFVSDLNSQDKDPIKSIHFSNSNPVCHAYDPDAKDGHDLLIGLNSGDVYSVSLRQQLQDVGKKLVGAQHYNKDGAVNNSRCTCITWIPNGDGSFVVSHADGNMY...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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