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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003133`

染色体: Chr08 坐标: 31674095-31676720 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003133`
名称	SmilChr08G003133
描述	serine/threonine-protein kinase-like protein CCR1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	31674095 - 31676720 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997723`
GeneID	`130997723`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997723`
原始查询	`SmilChr08G003133`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein kinase-like protein CCR1
产物	serine/threonine-protein kinase-like protein CCR1
Arabidopsis	`AT3G09780` (CCR1) CRINKLY4 related 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820136] identity=59.6; qcov=0.999; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0637800` (OsCR4) - identity=33; qcov=1.05; evalue=1.78e-117; confidence=low
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997723

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057779117.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779117.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779117.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779117.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779117.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:31674464`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C8,D7
`Chr8:31674667`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr8:31675058`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A10,A11,A3,C65
`Chr8:31675118`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C73
`Chr8:31675153`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B135,B19
`Chr8:31675153`	`GAT`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B135,B19
`Chr8:31675162`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B135,B19
`Chr8:31675162`	`G`	`GAT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B135,B19
`Chr8:31675530`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A22,A7,B8
`Chr8:31675658`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr8:31675669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28
`Chr8:31675694`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,A11,A13,A3,C65

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779117.1

758 aa

379

758

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 503-650 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 506-658 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779117.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	503	650	4.8e-31	108.8	Protein kinase domain
`XP_057779117.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	506	658	3.2e-35	122.4	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923134.1
TGATTGTTGTATGGTAGTAGAGTAAAGTGGCGAAATATTTTACAGAAAGTAGAAAGCAAGAAAAGCGTAAATATGGGTAGAGGCGCAACGCCCACGTTCTCTCTTCATCCCTCCATGTCCTCTATACCACTCCAGCTCTCTACTACTAGTCTCAGTCTGGTGGATCACAATCATGAAAATCCCTTTCAACTTGTTCTCAGCGCCTTGGCCTTATCTGCTACTCCTCTATCTACTCATTATCGCCGGTTCCGCTTATGGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997723
ATGAAAATCCCTTTCAACTTGTTCTCAGCGCCTTGGCCTTATCTGCTACTCCTCTATCTACTCATTATCGCCGGTTCCGCTTATGGCTTCGGCTCCATGGGCCCCATTTCAGCCTCCTTCGGAGATCACGCTCTCTTCTGCGCCATTGATGCCAGCGGCAAGCAAGCCGTCGTTTGCTGGGACGCCAACAACAGCTCCTCCACGGCCTCCACCGCTCTGCCTCCCATGGCCGCGCTCTCCGGCGGGGAGGGCTTTCTCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779117.1
MKIPFNLFSAPWPYLLLLYLLIIAGSAYGFGSMGPISASFGDHALFCAIDASGKQAVVCWDANNSSSTASTALPPMAALSGGEGFLCGIAADTSQPLCWDSTGFAQASDLVPEAFKLNSYSHIASGKDHVCAIRGSYFSENVSGSVDCWDVVRVSNTSLTSKQSVRFYDQNTSSLVFTRLVSGDGFSCGVIIDGGIACWGPNSTALGVSGVSENFVALASNVESICGVSQRSGEVKCWGNSDTPPAGMRLVALAAGSQHF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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