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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003139`

染色体: Chr08 坐标: 31800514-31802124 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003139`
名称	SmilChr08G003139
描述	uncharacterized SmilChr08G003139
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	31800514 - 31802124 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998325`
GeneID	`130998325`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998325`
原始查询	`SmilChr08G003139`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0658400; species=rice; confidence=high
产物	hit=Os06g0658400; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G17450` (AT3G17450) hAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821009] identity=22.8; qcov=1.12; evalue=4.16e-32; confidence=weak
Rice	`Os06g0658400` - identity=52.7; qcov=0.974; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0003677 (DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF02892 (zf-BED); PF04937 (DUF659)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998325

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779736.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057779736.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779736.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779736.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779736.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:31800532`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B22
`Chr8:31800538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B113,C33,C59
`Chr8:31800620`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A11,B91,C9,D1
`Chr8:31800633`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	A6,B97,C23
`Chr8:31800633`	`A`	`AG`	1bp_insertion	CDS_variant	3	A6,B97,C23
`Chr8:31800647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,C34,C75
`Chr8:31800669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A9,B113,B12,B137,B71
`Chr8:31800843`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B113,B90
`Chr8:31800854`	`T`	`TAA`	2bp_insertion	frameshift_variant	16	A10,A14,B10,B22,B3,B31,B48,B55,B83,B93,C27,C36,C46,C72,C8,C83
`Chr8:31800857`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,C46
`Chr8:31800880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B126,B91,B97,C3
`Chr8:31801019`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A14,C21,C36,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779736.1

536 aa

268

536

zf-BED

DUF659

PF02892 zf-BED 27-67 aa PF04937 DUF659 204-365 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779736.1`	Pfam	`PF02892`	zf-BED	Domain	27	67	6.5e-05	23.6	BED zinc finger
`XP_057779736.1`	Pfam	`PF04937`	DUF659	Domain	204	365	5.6e-46	156.6	Domain of unknown function (DUF659)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923753.1
ATGGATTCTTCAAGTTCTGTTCATGCTGATGGTGATACAAATGAAAATGATAATGAGAAGGAGAGTTCTAGCTGTTGGCCTTTGTGGAAATATGTAGAGAAGCAATCGAAAATTGGTAAAGGGGGTGGAAATACAAAATTTAAATGTATGTATTGCAAAAATGTGTATACTGGGTCTTACTCAAGATTGAGGAATCATTTGTTGAAAAATTCTGGTTTGGGAATTGCCATATGCCATAAAGCTACTGTTGCCAATGTACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998325
ATGGATTCTTCAAGTTCTGTTCATGCTGATGGTGATACAAATGAAAATGATAATGAGAAGGAGAGTTCTAGCTGTTGGCCTTTGTGGAAATATGTAGAGAAGCAATCGAAAATTGGTAAAGGGGGTGGAAATACAAAATTTAAATGTATGTATTGCAAAAATGTGTATACTGGGTCTTACTCAAGATTGAGGAATCATTTGTTGAAAAATTCTGGTTTGGGAATTGCCATATGCCATAAAGCTACTGTTGCCAATGTACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779736.1
MDSSSSVHADGDTNENDNEKESSSCWPLWKYVEKQSKIGKGGGNTKFKCMYCKNVYTGSYSRLRNHLLKNSGLGIAICHKATVANVLEMSKMEEQASRKRDAVKIKDIPLPRSVCDSVGSFSVTMTEVEPSSFKLEGYDPLKKRKIVDGPLGKAFNAQAREILDGEIARMFYSAGLPFNLAKNPHFIKSYSLAANSNVAGYNPPGYNALRTKLLKKERSHLQTLLEATKSTWKSKGVTIVCDGWTDPQRRPLINFMAINE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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