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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003140`

染色体: Chr08 坐标: 31802188-31802801 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003140`
名称	SmilChr08G003140
描述	uncharacterized SmilChr08G003140
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	31802188 - 31802801 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997729`
GeneID	`130997729`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997729`
原始查询	`SmilChr08G003140`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0658400; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0658400; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G33406` (AT5G33406) hAT dimerization domain-containing protein / transposase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833333] identity=38; qcov=0.649; evalue=5.35e-22; confidence=medium
Rice	`Os06g0658400` - identity=49.4; qcov=0.931; evalue=2e-39; confidence=medium
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF05699 (Dimer_Tnp_hAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997729

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779120.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779120.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779120.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779120.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779120.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:31802262`	`C`	`CA`	1bp_insertion	frameshift_variant	20	A19,B19,B39,B44,B48,B54,B77,B79,B90,C1,C34,C36,C39,C43,C58,C77,C79,C83,D3,D7
`Chr8:31802282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr8:31802307`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B63,B83,C42,C49,C82
`Chr8:31802318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C1,C62
`Chr8:31802363`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B71,B78,B89,C61
`Chr8:31802375`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A24,B19,B22,B54,C36,C43,C83,D7
`Chr8:31802399`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A5,C56
`Chr8:31802451`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B22
`Chr8:31802451`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B22
`Chr8:31802497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62
`Chr8:31802583`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,B98,C3
`Chr8:31802584`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B50,B85,C37,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779120.1

174 aa

174

Dimer_Tnp_hAT

PF05699 Dimer_Tnp_hAT 32-111 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779120.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	32	111	1.3e-10	41.7	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923137.1
CATTACAGAGGATTGGATAAAAGAGCATCCGTATCTTCAAACACCAAATCACGATGCAGATATTGTTAAAATGACAAAAAATTGTATCAAACGTCTTTTTCCTGATGCAGAAACACGAACAGCAGTAACACTAGAGTTTGCTAATTTTTTTGGATGCTTTGAAGAGTTTGGTGATGAAGATTCTATACGAGATAGATTGAAGTTGGATCCACTGAAATGGTGGGTAGCTTATGGTATAGGAGCCCCACATCTTCGACCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997729
ATGACAAAAAATTGTATCAAACGTCTTTTTCCTGATGCAGAAACACGAACAGCAGTAACACTAGAGTTTGCTAATTTTTTTGGATGCTTTGAAGAGTTTGGTGATGAAGATTCTATACGAGATAGATTGAAGTTGGATCCACTGAAATGGTGGGTAGCTTATGGTATAGGAGCCCCACATCTTCGACCTCTTGCTGTGAGATTACTTGGTCAAGTTTCTTCTTCATCATGCTGTGAAAGGAATTGGAGTACTTATTCATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779120.1
MTKNCIKRLFPDAETRTAVTLEFANFFGCFEEFGDEDSIRDRLKLDPLKWWVAYGIGAPHLRPLAVRLLGQVSSSSCCERNWSTYSFIHSTKRNRITVERADDLVYVHSNLRLLSRRAPQYMKGESQMWDVAGDAFDAMDDIGILGIANLSLDEPELESILFCDDGEGEGPSNS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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