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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003145`

染色体: Chr08 坐标: 31861222-31862532 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003145`
名称	SmilChr08G003145
描述	protein S40-4-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	31861222 - 31862532 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997733`
GeneID	`130997733`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997733`
原始查询	`SmilChr08G003145`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein S40-4-like
产物	protein S40-4-like
Arabidopsis	`AT3G45210` (AT3G45210) transcription initiation factor TFIID subunit (Protein of unknown function, DUF584) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823657] identity=47.9; qcov=0.986; evalue=1.51e-31; confidence=medium
Rice	`Os04g0520700` (OsS40-13) - identity=44.2; qcov=1.21; evalue=1.03e-28; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04520 (Senescence_reg)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997733

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779126.1`
2	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779126.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057779126.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779126.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779126.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:31861798`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr8:31861801`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B36
`Chr8:31861856`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B13,C8
`Chr8:31861911`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B12,C39

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779126.1

142 aa

142

Senescence_reg

PF04520 Senescence_reg 42-142 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779126.1`	Pfam	`PF04520`	Senescence_reg	Family	42	142	6.7e-37	128.6	Senescence regulator

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923143.1
TAAACACAGATTTCGTATTGAGTATACGATTTAATCAATCCAAACTACAAAATCCGACCCGAATAAAATAATTTTCCTCATTCGGATATTCAATTACATTTCACCTCCTAATAAACTCTACGTAACTCCTCTTATTGGTAAGAATTTTTTTCTATTAAATTAATTAAAAAAGGGCAGAATTATTGGCAGAGCTTATCCAAAACAAACATTATATATATATTCAGAGCATTACAGCCAAACTCGTCCACCTGCAAATTTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997733
ATGGCAGCAGCCAAGAGCCACCGCTACCTCGGCGGCGCAGCCAGGCTCTCCTCGGCCGATCAATTCGAGTTCGACGAAGCCGACGTCTGGAACAACAACGACCAAACGGAGACCAGAAAATCCATTTCCAACAGCCCGCGCCCGCTGCGGAAACCCCTCCGGAAGACCGCCGACGCTCCGATCGGCGCGAAATCTCTGCCGGTGAACATTCCGGACTGGTCGAAGATCCTGAGGGGCGAGTGCAGGGGACGCGCCGGCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779126.1
MAAAKSHRYLGGAARLSSADQFEFDEADVWNNNDQTETRKSISNSPRPLRKPLRKTADAPIGAKSLPVNIPDWSKILRGECRGRAGDEDADDEENERMPPHEYLARTRVASLSVHEGIGRTLKGRDLSSLRNAIWKQTGFED

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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