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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003147`

染色体: Chr08 坐标: 31891029-31891784 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003147`
名称	SmilChr08G003147
描述	uncharacterized SmilChr08G003147
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	31891029 - 31891784 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998328`
GeneID	`130998328`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998328`
原始查询	`SmilChr08G003147`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0169300; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os12g0169300; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G47680` (AT3G47680) DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922] identity=30.6; qcov=0.39; evalue=4.92e-08; confidence=low
Rice	`Os12g0169300` - identity=24; qcov=0.996; evalue=9.79e-11; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998328

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779739.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779739.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779739.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779739.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057779739.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:31891039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B7
`Chr8:31891039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B7
`Chr8:31891043`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,C8
`Chr8:31891058`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	8	A3,B121,B122,B20,B66,B87,C1,C35
`Chr8:31891062`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B26
`Chr8:31891062`	`CA`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B26
`Chr8:31891065`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B121,B122,B20,B87,C1,C35
`Chr8:31891076`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	7	A3,B121,B122,B20,B87,C1,C35
`Chr8:31891083`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B122
`Chr8:31891087`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A7,B131,B137,C21,C71
`Chr8:31891091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B122,B84,B94,C46
`Chr8:31891097`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B20

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923756.1
ATGTCTTCTTGGATCTGCGTTAGCGAAGATAAGCAAAAAGGAAAAAATCAAAGAGGGGCGACGATGTGGGAACGTGTGCAGAATATGTATCATGAAGCTAAAAAAGAAAATCCAGATGAGATCGGCCCAAGGAATATCGAATCAATGAAAGGTCGTTTTAAACGACTTAATGAAAATGCAAACAAGTGGATTGCTGCTTGCAAAGAAGCAAATGCTAGAAAAAGAAGTGGAATGAGCCGGAAAGATATAGAGATGGAAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998328
ATGTCTTCTTGGATCTGCGTTAGCGAAGATAAGCAAAAAGGAAAAAATCAAAGAGGGGCGACGATGTGGGAACGTGTGCAGAATATGTATCATGAAGCTAAAAAAGAAAATCCAGATGAGATCGGCCCAAGGAATATCGAATCAATGAAAGGTCGTTTTAAACGACTTAATGAAAATGCAAACAAGTGGATTGCTGCTTGCAAAGAAGCAAATGCTAGAAAAAGAAGTGGAATGAGCCGGAAAGATATAGAGATGGAAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779739.1
MSSWICVSEDKQKGKNQRGATMWERVQNMYHEAKKENPDEIGPRNIESMKGRFKRLNENANKWIAACKEANARKRSGMSRKDIEMEAHSIYEAGGSKFQDLVVFNDVMSKHPKLNLAINEVGDDQESGGSTKRSKTSEDGDYFIPSNPETPTTGGSTMSRPTGRDKAKRKGKGKAMASESNEMYEEIRELRLSRDHENELMTAKIELEREKLKMNSLKMEKKMLVALLAKDYLSAEEEEMESHLIAILFAK

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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