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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003148`

染色体: Chr08 坐标: 31895826-31897200 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003148`
名称	SmilChr08G003148
描述	uncharacterized SmilChr08G003148
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	31895826 - 31897200 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998330`
GeneID	`130998330`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998330`
原始查询	`SmilChr08G003148`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=low
产物	MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859]; symbol=MUG7; hit=AT3G05850; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT3G05850` (MUG7) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3768859] identity=27.1; qcov=0.765; evalue=1.46e-28; confidence=low
Rice	`Os12g0597300` - identity=26.6; qcov=0.781; evalue=1.1e-24; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998330

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779740.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057779740.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779740.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779740.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779740.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:31895842`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B127,B130,C10
`Chr8:31895872`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr8:31895982`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B58,B9
`Chr8:31896011`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B58,B9
`Chr8:31896020`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C15
`Chr8:31896065`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B22,B55
`Chr8:31896072`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A6
`Chr8:31896083`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B11,B40,B61
`Chr8:31896090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B86,C86
`Chr8:31896094`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,C25,C66
`Chr8:31896108`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	46	A6,B100,B101,B107,B11,B120,B123,B13,B139,B15,B16,B2,B26,B34,B38,B39,B40,B49,B61,B71,B76,B83,B89,B97,C11,C15,C25,C35,C40,C45,C55,C58,C59,C64,C66,C69,C75,C77,C78,C8,C80,C85,C87,D10,D6,D7
`Chr8:31896112`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B98

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779740.1

366 aa

183

366

MULE

Transposase_mut

PF10551 MULE 84-178 aa PF00872 Transposase_mut 101-182 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779740.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	84	178	1e-16	61.8	MULE transposase domain
`XP_057779740.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	101	182	2.3e-07	30.8	Transposase, Mutator family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923757.1
ATGCAGCGCTTATTCGGGATTGAGATCAATTACAGTTTGGCTCTCCGTGCAAGAAATATCGCGATTGAGATCACGTATGGTGATTTTGGGAACTCCTATCAGATGCTCCCGTCGTATTTGTGTATGCTGAGAATGAGTAATCCTGACACGTTATATGACCTTGAGATGAAGGCTGATGGCGAGTTCCATCATATGTTTGTTGCACTTGGACAAAGCATGGCTGCCTTTGGGAATAGTTACTTGATGCCGGTCATCGTCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998330
ATGCAGCGCTTATTCGGGATTGAGATCAATTACAGTTTGGCTCTCCGTGCAAGAAATATCGCGATTGAGATCACGTATGGTGATTTTGGGAACTCCTATCAGATGCTCCCGTCGTATTTGTGTATGCTGAGAATGAGTAATCCTGACACGTTATATGACCTTGAGATGAAGGCTGATGGCGAGTTCCATCATATGTTTGTTGCACTTGGACAAAGCATGGCTGCCTTTGGGAATAGTTACTTGATGCCGGTCATCGTCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779740.1
MQRLFGIEINYSLALRARNIAIEITYGDFGNSYQMLPSYLCMLRMSNPDTLYDLEMKADGEFHHMFVALGQSMAAFGNSYLMPVIVVNGTHLKGMNSGILFVAVTKDGNEGIFPLAVGLGPIENDESWTWFFHRPRSFFGQPDDLLIVSDQHKSIRNAAECVYPNVPHGLCYYHLQKNLAHYGLHVAAVFKAAAYSYRSDDFHRNFSALEVLKVNAHTRLDTIGVERWARSKCPVRRTSFMTSNAAETMNSRLLWARRLP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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