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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003153`

染色体: Chr08 坐标: 32043989-32050116 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003153`
名称	SmilChr08G003153
描述	uncharacterized SmilChr08G003153
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	32043989 - 32050116 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997740`
GeneID	`130997740`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997740`
原始查询	`SmilChr08G003153`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os01g0595300; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os01g0595300; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G06740` (MUG3) MuDR family transposase [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:3766669] identity=28.8; qcov=0.916; evalue=5.32e-40; confidence=low
Rice	`Os01g0595300` - identity=29.4; qcov=0.868; evalue=7.62e-41; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00872 (Transposase_mut); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997740

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779133.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057779133.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779133.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779133.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779133.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:32044807`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	B109,B112,B131,B2,B23,B29,B3,B31,B4,B63,B70,C16,C19,C23,C3,C42,C52,C60,C86,C9,D10,D2
`Chr8:32044846`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	59	A14,A15,A19,A20,A5,A9,B108,B114,B121,B124,B130,B135,B136,B21,B25,B27,B38,B39,B48,B49,B58,B6,B60,B61,B64,B65,B66,B69,B74,B75,B78,B82,B84,B90,B98,B99,C13,C26,C27,C28,C30,C37,C4,C48,C49,C50,C51,C52,C55,C63,C67,C7,C71,C73,C76,C78,C84,C87,D1
`Chr8:32044883`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr8:32044980`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C4
`Chr8:32045060`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr8:32045080`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,A23,B13
`Chr8:32045086`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A11,A23,B13
`Chr8:32045200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr8:32045235`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr8:32045236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C14,C35
`Chr8:32045262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B18,B87,C31,C67
`Chr8:32045266`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779133.1

356 aa

178

356

MULE

Transposase_mut

PF10551 MULE 192-286 aa PF00872 Transposase_mut 209-328 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779133.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	192	286	1.8e-19	70.6	MULE transposase domain
`XP_057779133.1`	Pfam	`PF00872`	Transposase_mut	Family	209	328	1.8e-10	41.0	Transposase, Mutator family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923150.1
TAGAAGATGAAACAAACTTAAATTCAATCAACATAATCTTGGATATAACTTGTGTAAAGATGAAGCGAAAAGGCAAAGACACGAGTTAAATCGGAAATAAAAGAGTAGCAATACAATTGCAAATCTCCCCCGTGCTTTGTCAACAACATTTCAATCTAAACACAAACCATCCGAGTCATGCCCACCACACATTTGCCATCTCACTTGTTAGCAACTGCCCTGAAAAGTCCACTGTCTCTTTGATGTATGTGGCTTGAATA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997740
ATGTATTTCAATAGCAAAGATGATCTGATCGTTGCAATCGATCTGTGGAACATGAAGCAGGGCAAGGAATTTTCTGTCAGCAAATCAGACAGCAGACGAATTTACTTCAAATGCAAGCATTCAGATACGTGCCCCTTCAAGCTCCATGCATCGTCACAAGATGGAGCCATTTGGGGAGTGTATAAGTTCACCAATGAGCACTCATGCGACGGTGAATTAGGGCGCATAGCGCGAATAAAGGCCCCCGCAAAAGTCGTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779133.1
MYFNSKDDLIVAIDLWNMKQGKEFSVSKSDSRRIYFKCKHSDTCPFKLHASSQDGAIWGVYKFTNEHSCDGELGRIARIKAPAKVVAAYLAQKIHDDCEILKPKAIQLELRREFGVQIKYDVALRARNRATEMVYGRYDQSFEMLPKYLYMLRQSNPGSMVEWEVGDDGRFKHLFVALAASATPFMFSLRPVIVVDGTHLKGKNRGILFVAVTKDGNESLFPLAYGVGPKENDESWTYFMSRIQRVYGQANPLLIVSDQH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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