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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003159`

染色体: Chr08 坐标: 32138981-32141823 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003159`
名称	SmilChr08G003159
描述	protein CNGC15b-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	32138981 - 32141823 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997743`
GeneID	`130997743`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997743`
原始查询	`SmilChr08G003159`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein CNGC15b-like
产物	protein CNGC15b-like
Arabidopsis	`AT2G28260` (CNGC15) cyclic nucleotide-gated channel 15 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817372] identity=62.4; qcov=0.965; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0789100` (OsCNGC5) - identity=50.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005249 (voltage-gated potassium channel activity); GO:0006813 (potassium ion transport); GO:0016020 (membrane); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	smil04626 (Plant-pathogen interaction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00520 (Ion_trans)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997743

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057779136.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057779136.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779136.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779136.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779136.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:32139717`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	A24,B118,B67,B98,C86
`Chr8:32139717`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	A24,B118,B67,B98,C86
`Chr8:32139737`	`ACG`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	10	A11,A2,B102,B20,B46,B53,B66,B94,C33,C58
`Chr8:32139887`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr8:32139958`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:32140050`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr8:32140290`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	143	A1,A10,A11,A18,A2,A21,A23,A24,A3,A4,A7,B1,B10,B101,B102,B103,B106,B107,B109,B11,B114,B117,B118,B12,B122,B125,B126,B127,B13,B130,B131,B135,B139,B140,B15,B17,B19,B2,B20,B24,B27,B29,B3,B31,B33,B35,B38,B39,B4,B40,B41,B44,B45,B46,B48,B51,B53,B54,B55,B58,B62,B66,B67,B69,B73,B75,B76,B77,B78,B8,B80,B82,B83,B84,B87,B89,B91,B94,B95,B97,B98,C1,C10,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C26,C27,C28,C29,C30,C31,C32,C33,C34,C36,C37,C38,C39,C41,C42,C43,C44,C46,C47,C48,C52,C53,C55,C56,C58,C59,C63,C65,C68,C70,C71,C72,C73,C74,C76,C77,C8,C80,C82,C84,C86,C87,C9,D11,D2,D3,D4,D7,D9
`Chr8:32140326`	`CCG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	50	A10,A24,A3,A4,B1,B101,B107,B118,B126,B127,B13,B130,B140,B15,B29,B3,B35,B67,B69,B75,B8,B80,B82,B87,B95,B98,C10,C17,C18,C2,C24,C29,C32,C34,C38,C41,C44,C46,C48,C63,C68,C71,C74,C77,C86,C9,D11,D3,D4,D9
`Chr8:32140815`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B3
`Chr8:32140892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C15
`Chr8:32141005`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B47
`Chr8:32141130`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A15,B33

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779136.1

658 aa

329

658

Ion_trans

PF00520 Ion_trans 47-367 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779136.1`	Pfam	`PF00520`	Ion_trans	Family	47	367	3.1e-19	69.8	Ion transport protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923153.1
TTAACTATAGGAGTTTAAAAGTTTATTTTACCAAATACTTTTCAGGAAGGGAAGGGATTGCAGAAAAGATATAGCATGGATAGCTACTTCACGAAGAAAGTTTGTGACTAAGCTATAAGGACTGGAATTTTTCGTGCTGACTGCTAAAACAGAGGATTCCTTGTCTTGATTGTATATGTGAAACTGGACCCTAAAATAACAAAACTCAGATGTTCTTGCTACAGATACTTATATAGTCAAATGAATTAAGTCAGCTACAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997743
ATGAGACATTTGACAAGCGCGAGATTTGAGGAAACGGCAAAGTCATCTCCCAGCAAGAAGAAACTTTCGAGAGTATTCTCTGAGGACTACGAGATAGTGCAGAAGAAGATATTTGATCCACGAGGATCTTTTCTGAGCACGTGGAATAAATATTTCCTAATCTCATGTCTGATTTCCCTCTTCGTGGACCCCCTCTTCTTCTATTTACCCAACGTTGAGCAAGAAGCGTGCATGCAGTCCTCCGTCCCCCTCGAGATAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779136.1
MRHLTSARFEETAKSSPSKKKLSRVFSEDYEIVQKKIFDPRGSFLSTWNKYFLISCLISLFVDPLFFYLPNVEQEACMQSSVPLEIALTLTRCIVDASYVIHIFVRFRTAYTAPSSRIFGRGELVIDSSKIASRYLRTHFWFDLLAALPLPQLLIWVVIPCLRGSNVIGAKHGLRVTIIFQFLLRLYLVFPLSSKIITTAGVVVEAAWAGAAFNLMLFMLASHVIGSLWYLLSIERQEMCWKSVCDAQXPNCHYLYFDCK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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