当前解析结果
SmilChr08G003165| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003165 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003165 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003165 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 32282864 - 32286532 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130998338 |
|---|---|
| GeneID | 130998338 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130998338 |
| 原始查询 | SmilChr08G003165 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | hit=Os06g0521000; species=rice; confidence=low |
| 产物 | hit=Os06g0521000; species=rice; confidence=low |
| Arabidopsis | AT1G66235 (AT1G66235)no-apical-meristem-associated carboxy-terminal domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842939] identity=28; qcov=0.623; evalue=3.94e-11; confidence=low |
| Rice | Os06g0521000- identity=33.1; qcov=0.599; evalue=3.98e-19; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130998338 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057779746.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779746.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779746.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057779746.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057779746.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:32282868 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B4,C36,C46 |
Chr8:32282872 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A7,B120,B127,C3,C33 |
Chr8:32282903 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B136,C27,C29,C53 |
Chr8:32285968 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B91,C72 |
Chr8:32285975 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B91,C72 |
Chr8:32285977 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A8,B41,C37,C4 |
Chr8:32286033 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B91,C72 |
Chr8:32286065 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B58,C71 |
Chr8:32286074 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 9 | B122,B13,B63,B93,B96,C16,C17,C57,C64 |
Chr8:32286179 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C25,C9 |
Chr8:32286299 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A16,B134,C2,D7 |
Chr8:32286321 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B2 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。