当前解析结果
SmilChr08G003170| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003170 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003170 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003170 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 32371880 - 32373926 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130997753 |
|---|---|
| GeneID | 130997753 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997753 |
| 原始查询 | SmilChr08G003170 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | acyl-CoA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818296]; symbol=AT2G37195; hit=AT2G37195; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | acyl-CoA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818296]; symbol=AT2G37195; hit=AT2G37195; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT2G37195 (AT2G37195)acyl-CoA-binding domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818296] identity=54.3; qcov=0.806; evalue=7.23e-37; confidence=medium |
| Rice | Os02g0805700- identity=42.5; qcov=0.662; evalue=7.53e-21; confidence=medium |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997753 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Endoplasmic reticulum | 内质网 | 0.80000 | XP_057779145.1 |
| 2 | Endoplasmic reticulum membrane | 内质网膜 | 0.80000 | XP_057779145.1 |
| 3 | Golgi apparatus | 高尔基体 | 0.60000 | XP_057779145.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.20000 | XP_057779145.1 |
| 5 | Nucleus membrane | 核膜 | 0.20000 | XP_057779145.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:32373671 |
CT |
C |
1bp_deletion | frameshift_variant | 176 | A11,A16,A18,A2,A20,A22,A23,A24,A3,A4,A5,A6,A7,B100,B101,B102,B103,B105,B106,B107,B108,B111,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B120,B121,B122,B123,B124,B126,B129,B130,B131,B132,B134,B135,B136,B138,B139,B17,B18,B2,B20,B22,B23,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B31,B33,B34,B35,B37,B38,B39,B4,B40,B42,B43,B45,B46,B49,B5,B50,B51,B52,B54,B55,B56,B57,B59,B6,B60,B61,B63,B64,B66,B67,B68,B69,B7,B75,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B86,B87,B89,B9,B90,B91,B92,B95,B96,B97,B98,C1,C11,C13,C14,C15,C19,C2,C20,C21,C23,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C39,C41,C43,C44,C45,C46,C47,C49,C5,C52,C53,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C65,C67,C68,C69,C7,C71,C72,C73,C75,C76,C77,C78,C79,C80,C81,C82,C84,C85,C86,D1,D2,D4,D8,D9 |
Chr8:32373685 |
TA |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 9 | A19,A23,B102,B11,B127,B40,B81,C16,C3 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。