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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003174`

染色体: Chr08 坐标: 32428791-32432555 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003174`
名称	SmilChr08G003174
描述	uncharacterized SmilChr08G003174
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	32428791 - 32432555 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130998342`
GeneID	`130998342`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130998342`
原始查询	`SmilChr08G003174`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os03g0643433; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G43760` (AT1G43760) DNAse I-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840968] identity=29.8; qcov=0.345; evalue=5.87e-35; confidence=low
Rice	`Os03g0643433` - identity=27; qcov=0.535; evalue=6.07e-53; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00078 (RVT_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130998342

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779751.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057779751.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057779751.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779751.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779751.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:32428792`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	12	A1,A25,B113,B19,B2,B28,B69,C31,C39,C66,C68,C70
`Chr8:32428820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B12,B97,C73
`Chr8:32428822`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr8:32428838`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B32,B69,B94
`Chr8:32428848`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B42,C47,D4
`Chr8:32428850`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:32428855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B71,C62
`Chr8:32428882`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,D11
`Chr8:32428903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A25,B125,C21
`Chr8:32428903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A25,B125,C21
`Chr8:32428973`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C21
`Chr8:32428973`	`C`	`CT`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779751.1

990 aa

495

990

RVT_1

PF00078 RVT_1 480-700 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779751.1`	Pfam	`PF00078`	RVT_1	Domain	480	700	4.5e-23	82.9	Reverse transcriptase (RNA-dependent DNA polymerase)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923768.1
ATGAAGTTTCCTGATCAGCAGCAGCAGGTTATGTCTCAGCAGCAACAGCAGGTGAATGCCGATCAGCAGCAGCAGAGGACGCCCGATCAGCAGCCTCAGCATCAGTCCGATGCTAAGATCGCAGTCGATGATCAGAACGCAGTGGCTAAACAACAGGATCAGGGGACGACTTTGGATAGTCGGCGAACGACGGGTTTGGCTTTTGAAAATCAAATAAGAGTTCAGAGAAATGAGCGGCACGACAGGTGCTCGAACATTTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130998342
ATGAAGTTTCCTGATCAGCAGCAGCAGGTTATGTCTCAGCAGCAACAGCAGGTGAATGCCGATCAGCAGCAGCAGAGGACGCCCGATCAGCAGCCTCAGCATCAGTCCGATGCTAAGATCGCAGTCGATGATCAGAACGCAGTGGCTAAACAACAGGATCAGGGGACGACTTTGGATAGTCGGCGAACGACGGGTTTGGCTTTTGAAAATCAAATAAGAGTTCAGAGAAATGAGCGGCACGACAGGTGCTCGAACATTTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779751.1
MKFPDQQQQVMSQQQQQVNADQQQQRTPDQQPQHQSDAKIAVDDQNAVAKQQDQGTTLDSRRTTGLAFENQIRVQRNERHDRCSNIWVLHHPDVAFRLVFSSEQTVIADCHWNSFDFWVAIVHGASTHVERRSLWADLINFTADSMVILGDFNAVKGAHERISSCMPSQASCREFCDFIDDTGFIESATSGLRFTWSGRRFMPRHVESFLDRALYSELFSSLWHSVHTLNLARLTSDHSPIVFQCSLPPQTRHRFFRFLN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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