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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003193`

染色体: Chr08 坐标: 32729700-32733491 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003193`
名称	SmilChr08G003193
描述	40S ribosomal protein S14-3-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	32729700 - 32733491 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997772`
GeneID	`130997772`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997772`
原始查询	`SmilChr08G003193`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	40S ribosomal protein S14-3-like
产物	40S ribosomal protein S14-3-like
Arabidopsis	`AT3G52580` (AT3G52580) Ribosomal protein S11 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824424] identity=91.4; qcov=0.927; evalue=3.61e-93; confidence=high
Rice	`Os02g0162500` - identity=93.5; qcov=0.927; evalue=2.8e-95; confidence=high
GO	GO:0000028 (ribosomal small subunit assembly); GO:0000462 (maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0003735 (structural constituent of ribosome); GO:0005840 (ribosome); GO:0006412 (translation); GO:0022627 (cytosolic small ribosomal subunit); GO:0048027 (mRNA 5'-UTR binding); GO:0070181 (small ribosomal subunit rRNA binding)
KEGG	smil03010 (Ribosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00411 (Ribosomal_S11)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997772

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057779181.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057779181.1`
3	Nucleolus	核仁	0.40000	`XP_057779181.1`
4	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057779181.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779181.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:32731854`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	D10,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779181.1

150 aa

150

Ribosomal_S11

PF00411 Ribosomal_S11 28-146 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779181.1`	Pfam	`PF00411`	Ribosomal_S11	Family	28	146	3.6e-47	160.0	Ribosomal protein S11

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923198.1
AAAAACTCTCTCCTTCTTTCCTCCCGTTTCTTCTCCTCCCACGCCACCCCACCCACTGTAGCAGCTCCCCTCCTGCCACAACTTCTTCGCGGGTGGTTTGCTATGTAGAGTTGATTCAGCTGATATTGTTGGGTCGTGAAAAGAATTACCCATCTGGGCCCATTATTAACTTGAACAAGCCCATTCACTATGTCAGTCAATAAGCCCACAACAAATCCTGCTAAAGACCTAGCTATAAATTTGAGGCTTACTATATTACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997772
ATGTCGAAGAGAAAGACTAGAGAGCCCAAGGAAGAGAATGTCACACTTGGACCTGCTACTAGGGACGGCGAATTGGTCTTTGGTGTTGCCCACATTTTTGCCTCATTCAATGACACCTTCATTCACGTGACTGATTTGTCTGGGCGTGAGACCATGGTCCGCATTACAGGTGGTATGAAGGTCAAAGCTGATAGAGACGAGTCATCTCCCTATGCTGCTATGCTTGCAGCACAAGATGTTTCTCAGAGATGCAAGGAATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057779181.1
MSKRKTREPKEENVTLGPATRDGELVFGVAHIFASFNDTFIHVTDLSGRETMVRITGGMKVKADRDESSPYAAMLAAQDVSQRCKELGINALHIKLRATGGNKTKTPGPGAQSALRALARSGMKIGRIEDVTPIPTDSTRRKGGRRGRRL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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